Månedens stipendiat - April 2006

Kristine Magnus

Ingunn Alne Hoell er månedens stipendiat i april 2006. Ingunn er småbarnsmor, utdannet ved NLH og tar nå doktorgrad ved UMB, nærmere bestemt i forskningsgruppen Protein engineering og Proteomikk (PEP). I sitt doktorgradsarbeid har hun hovedsakelig jobbet med enzymer for å bearbeide polysakkaridet kitin.

Fra mikrobiologi til proteomikk

Ingunn Alne Hoell Foto: Kristine V Magnus

Jeg heter Ingunn Alne Hoell og er 29 år. Siden juni 2002 har jeg jobbet som stipendiat på forskningsgruppen ”Protein engineering og Proteomikk” (PEP). PEP-gruppa er ledet av professor Vincent Eijsink, som også er min veileder. Jeg er utdannet Cand. Scient. ved Norges Landbrukshøyskole, hvor jeg i 2001 fullførte hovedoppgava mi ”Studier av kompetansegener hos Streptococcus thermophilus” på forskningsgruppa til professor Leiv Sigve Håvarstein, "Molecular Microbiology". Planen er at jeg skal fullføre doktorgraden min ved IKBM i løpet av sommeren 2007.

Studier av kitin
I mitt doktorgradsarbeid har jeg jobbet hovedsakelig med enzymer for å bearbeide kitin (og kitosan). Kitin er det nest mest forekommende polysakkaridet i naturen (etter cellulose), og består av N-acetylglukosamin. Mens kitin er et uløselig polysakkarid, er kitosan (som er delvis deacetylert kitin), løselig i vann. Kitin finnes mange steder i naturen, bl.a i celleveggen hos sopp og i skallet til insekter og skalldyr. Kitin utgjør store mengder avfall (bla innen fiskeriindustrien), noe som gjør det interessant for oss å finne anvendelsesområder for kitin for å utnytte dette råstoffet bedre. Jeg har derfor jobbet mye med å skaffe forskjellige enzymer som vi kan bruke til å lage nye produkter på basis av kitin. Med disse enzymene ønsker vi å kontrollert bryte ned kitin til kortere kitinfragmenter, kitooligosakkarider. Slike kitooligosakkarider er verdifulle og har mange bruksområder, bl.a innen landbruk og medisin.

Genteknologi
Selv om det finnes veldig mye kitin i naturen, hoper det seg ikke opp med kitinholdige materialer. Dette kommer av at både mange prokaryoter og eukaryoter produserer enzymer for å bearbeide kitin (som f.eks ulike kitinaser og kitin deacetylaser). Jeg har jobbet med å identifisere gener for slike enzymer (genom-mining), klone genene og overprodusere enzymene i E. coli, for deretter å rense og karakterisere enzymene. Det første enzymet jeg jobbet med var Ech30, en familie 18 endokitinase fra soppen Trichoderma atroviride P1. Når jeg overproduserte Ech30 i E. coli, støtte jeg på problemer med at proteinet dannet inclusion bodies (uløselig protein), men jeg klarte til slutt å refolde, rense og karakterisere enzymet.

Spennende bakterie med soppvekst
I det siste har jeg jobbet mest med ChiG, en familie 19 kitinase fra Streptomyces coelicolor. S. coelicolor er en veldig spennende organisme, det er en Gram positiv bakterie, men den vokser nesten som en sopp (danner mycel og sporer), og den produserer 13 forskjellige kitinaser/ kitosanaser. Blandt disse 13 enzymene er det to familie 19 kitinaser (ChiF og ChiG). Familie 19 kitinaser ble nylig oppdaget hos bakterier, de har tidligere bare blitt funnet i planter. Man tror at familie 19 kitinasene er overført fra planter til bakterier ved horisontal genoverføring. Arbeidet med ChiG har vært veldig spennende, og sammen med gode samarbeidspartnere har vi også klart å løse krystallstrukturen til ChiG.


Oppdatert: 26.03.06
Utskriftsvennlig versjon : Arkiv : Tips en venn