Høgskolen i Narvik er faglig organisert i fire institutter. 

- Institutt for data-, elektro- og romteknologi (IDER)
- Institutt for bygnings-, drifts- og konstruksjonsteknologi (IBDK)
- Institutt for anvendte vitenskaper (IAV)
- Institutt for helse og sykepleievitenskap (IHSV)

I tillegg har høgskolen en filial i Alta som tilbyr forkurs og første år ingeniør, samt en filial i Bodø som tilbyr forkurs (og første år ingeniør fra og med høst -08).