Research

  Mikroorganismer som plantepatogener - Tørråte


Mikroorganismer som angriper en plante skiller ut enzymer som muliggjør invasjon av planten og/ eller som er med på å unnvike plantens forsvarsmekanismer. Det finnes flere grunner for at disse enzymer er meget interessante, blant annet følgende:
Identifikasjon av nøkkelenzymer kan gi grunnlag for utvikling av nye bekjempelsesstrategier (f eks enzymhemmere).
De patogenene mikroorganismens enzymer er ofte svært effektive i nedbryting av bestemte plantematerialer. Dette betyr at disse enzymer kan være interessante som biokatalysatorer, dvs at de muligens kan anvendes til industriell bearbeiding av råstoffer fra landbruket (f eks i fôrindustrien).
Interaksjoner mellom planter og sykdomsfremkallende mikroorganismer (heretter kalt "patogener") får mye oppmerksomhet i disse dager, ikke minst fordi de nye DNA mikromatrise teknikker gir fantastiske muligheter til å se på gener som blir skrudd av og på under infeksjonsprosesser. I prinsippet kan genetiske analyser av infeksjonsprosesser gi innsikt i hva som kan være nøkkelenzymer for plantepatogene mirkoorganismer. På tross av nye genetiske teknikker er framgangen i det å oppnå nærmere forståelse av infeksjonsprosesser beskjeden.
I dette prosjektet ønsker vi å bruke en mer protein-basert tilnærming til plante-patogen interaksjoner. Ved å bruke teknikker innen "proteomics" samt en del kunnskap om enzymer og enzymologi ønsker vi å se direkte på proteiner som kan spille en rolle under infeksjonsprosesser. Vi fokuserer først og fremst på interaksjonen mellom potet og tørråte soppen Phytophtora infestans. På tross av det faktum at tørråte er en av de mest ødeleggende og kostbare plantesykdommer i verden er fortsatt lite kjent om de molekylære mekanismer bak infeksjonsprosessen. Det har blitt gjort forbausende lite på studier av de enzymene som produseres og det kan derfor synes på tide å ta i bruk moderne "proteomics" teknikker for å komme videre.
Prosjektet er rettet mot identifikasjon og detaljerte studier av enzymer fra P. infestans, med fokus på enzymer som spiller spesielle roller under infeksjonsprosessen. Målet er å skaffe grunnleggende informasjon om utvikling av tørråte sykdommen og å skaffe nye interessante enzymer med potensial som biokatalysatorer. Mot slutten av prosjektet kan det bli aktuelt å bruke en del av de etablerte teknikker og (enzym) screeningsmetoder til å se på andre interessante plantepatogener. Her vil målet først og fremst være å framskaffe nye biokatalysatorer.

Bildene viser potetplanten (til v.) og selve poteten (til h.) angrepet av tørråte.

 

Optional text

[link]
[link]
[link]