|
MAT-3211: Bioinformatikk Omfang
10 studiepoeng | Emnetype
Teoretisk. | Emnenivå/studieår
Emne på masternivå. | Undervisningsspråk
Norsk, engelsk ved behov | Eksamenssemester
Høst
| Innhold
Emnet vil behandle grunnleggende metoder for analyse av protein- og DNA-sekvenser. Tema som vil bli tatt opp er alignment ved dynamisk programmering og metoder for etablering av phylogenetiske trær. I tillegg vil det bli etablert metoder for statistisk undersøkelse og gjenkjenning av biologisk funksjon og klassifikasjon ved proteinfamilier ved forskjellig type feature og clustering metoder. Kurset vil også inneholde en kort innføring i viktige biokjemiske modeller og parametere til bruk i biologisk interpretasjon av resultatene fra analyse av sekvensdataene. Det vil bli gitt obligatoriske oppgaver der studenten får utvikle og prøve metodene i praksis på realistiske proteinfamilier og sekvensdata fra databanker. | Anbefalte forkunnskaper
INF-1100 Innføring i programmering, MAT-1002 Kalkulus 2, MAT-1004 Lineær algebra | Undervisning
Forelesninger: 40 t
Øvelser: 30 t | Arbeidskrav
Obligatoriske øvelser
| Eksamen og vurdering
Muntlig eksamen. Bokstavkarakterer (A-F). | Kontaktperson
Prof. Tor Flå, tlf. 77 64 40 24, e-post: tor@math.uit.no
Kontorsjef Helge Johansen, tlf. 77 64 51 30, e-post: helge.johansen@matnat.uit.no | Pensum
Ta kontakt med instituttet/fakultetet | Hjemmeside
http://uit.no/matstat/mat-3211/
| Timeplaner
http://timeplan.uit.no/emne.php?year=2007&department=ALLE&module=MAT-3211-1 |
Undervisning høsten 2007
Første oppmøte: Tirsdag 21.08. U.rom 5, Realfagsbygget
Ansvarlig fagperson: Prof. Tor Flå |
|
