Av større prosjekt ved samlinga kan nevnes

Kolasamisk Musikalsk Tradisjon
Det blei i perioden 1994-97 samla inn store mengder samisk joik fra Kolahalvøya. Prosjektet var finansiert av Nordisk Ministerråd (NOS-H) og hadde deltakere også fra Russland, Finland og Estland. Arbeidet ble initiert og ledet fra Nordnorsk Folkemusikksamling, Tromsø Museum.

I samarbeide med Global Music Center i Helsinki skal det gis ut en dobbel-CD med skoltesamisk materiale. Planlagt utgivelsesdato er mai 2007. Planen er at denne skal deles ut gratis til alle skoler på Kolahalvøya som har samiske skolebarn, og til samiske organisasjoner, bibliotek, kulturhus og andre interesserte institusjoner.

Positivslåtter
I samarbeid med Marit Mikkeljord i Susendal arbeides det med å få overført gamle positivnoter fra Susendal til vanlig noterskrift. Et utvalg av disse vil bli trykt i et eget hefte. Prosjektet støttes av Norsk Kulturråd og Nordland fylke. Arbeidet med positivtradisjonen har resultert i en artikkel "Det positive Helgeland", Ottar nr. 5, 2002.

Sjøsamisk joik
Det har i en årrekke vært arbeidet med innsamling og dokumentasjon av en lokal sjøsamisk joiketradisjon i Måsøy kommune i Finnmark. Dette arbeidet resulterte i ei akademisk avhandling ”Joik på nordkysten av Finnmark”, Tromsø Museum 2001. Avhandlinga foreligger i en omarbeida, forkorta og forbedra versjon på Davvi Girji forlag, ”Om kjæresten min vil jeg joike”, 2004. Melodieksemplene i boka er lagt ut på denne hjemmesida (se ovenfor). En kort oversikt finnes i artikkelen ”Joik i Snefjord – tradisjon og fornorskning” i Tromsø Museums skrifter XXX, 2003.

Identitetstilskriving i joik
Det har vært arbeidet med spørsmålet om hvordan joik tilskriver individuell, sosial og kulturell identitet på ulike måter og ulike nivå. ”Mening i joiken – en allmenn teoretisk basis” som er kapittel 6 i ”Om kjæresten min vil jeg joike” (2004), utvikler en teoretisk forståelse basert på semiologisk teori. Synspunktene er videreutviklet i artikkelen ”Kem e du – Om joik som identitetsmarkering” (2005).

Slåttesamling etter Daniel Hægstad
Daniel Hægstad fra Lødingen skreiv ned over 100 slåtter fra sitt område i ulike manuskripter. Museet har samlet mange av disse manuskriptene og vil utgi hele samlinga i bokform. Planlagt utgivelse er høsten 2007.

Musikalsk struktur i joik
Det arbeides kontinuerlig med spørsmålet om joikemelodienes musikalske struktur. Artikkelen ”Om å forstå joikemelodier. Refleksjoner etter et opphold ved SOFI i Uppsala” tar for seg hvordan en del utvalgte melodier fra Pite-samisk område er blitt misforstått tidligere. Artikkelen ventes å bli publisert i 2007.

Nordnorsk tradisjonsmusikk
I samarbeid med NRK-Nordaførr blei det i perioden januar 1998 – juni 2000 lagd ukentlige program om nordnorsk tradisjonsmusikk. Serien resulterte i mye nytt materiale fra lytterne. Med bakgrunn i disse programmene er det lagd ei bok ”Av det raudaste gull. Tradisjonsmusikk i nord”, gitt ut på Orkana forlag i 2005. Melodieksemplene i boka er lagt ut på denne hjemmesida (se ovenfor).