Samlingen omfatter fartøyer og utstyr knyttet til den Kongelige Norske Marinen, alliert og tysk utstyr, fartøymodeller, malerier og bilder for å nevne noe. Dessuten står museet som eier av "Shetlandsbussen" Hitra, en "subchaser" som gjorde tjeneste mellom Shetland og Norge fra 1943 til 2.verdenskrig var over og deretter i Norge fram til 1954.

Sommeren 1998 fikk museet en verdifull tilvekst til utstillingen i form av en Kobben-klasse undervannsbåt som er tilrettelagt for publikum og plassert utenfor museet.

Ved skriftlig henvendelse per telefaks eller brev kan museet være behjelpelig med kopier av tegninger og annen dokumentasjon i den grad det er mulig, mot et mindre honorar i form av kopi- og arkiv-avgift.

Museet ble grunnlagt 5. oktober 1853 etter kongelig resolusjon basert på en samling av gjenstander som den danskfødte kommandørkaptein C. F. Klinck hadde organisert og delvis selv samlet inn i løpet av sin mer enn 40-årige sjømilitære karriere. Samlingen ble gitt som gave til den daværende Marinekommandoen. Kommandørkaptein Klinck var en veteran fra krigen mot England (1807-1814), og da Norge kom i union med Sverige, fortsatte han i norsk tjeneste. I årene fremover tjenestegjorde han som skipssjef på flere av våre orlogsskip.

Utstillingen
De gjenstandene Klinck donerte til museet, hadde han samlet fra sin tid i Marinen, fra krigen mot England i 1807-1814, og fra reiser til sjøs. Han hadde også fått sine kolleger til å ta med seg gjenstander fra alle verdens hjørner. Gjenstandene var typiske for hvordan man samlet museumsgjenstander i den tiden, de skulle være svært gamle og i mange tilfeller svært sjeldne. Vi finner en rekke gjenstander fra Kartago, Pompei og Egypt samt tøystykker fra Voltaires sengeforheng. Denne del av utstillingen har naturligvis fått tilført en rekke gjenstander gjennom årene, men museet forsøker å opprettholde inntrykket av det opprinnelige. Den Gamle Avdeling er derfor på mange måter et museum over museer, og med sitt litt usystematiske preg er den svært populær hos publikum.

Utstillingene på Marinemuseet viser et bredt spekter av fartøyenes utrustning gjennom tidene. Her finnes alt fra kaffekjelen til våpensystemer, legekontor og apotek. Møbler fra gamle skip er en naturlig del av utstillingene, og med den sans for soliditet som de gamle håndverkerne hadde, er det mulig for publikum å hvile bena i løpet av besøket, f.eks. i offisersmessen fra en torpedobåt fra 1896 eller i en undervannsbåt fra 1944.

Marinemuseet har Norges største samling av skipsmodeller. Til sammen er det utstilt 111 stykker, og den største er fregatten Freia, bygget i 1818. Den er 5 meter høy og måler nesten 8 meter fra klyver til mesanbom. Da modellen opprinnelig ble benyttet som undervisningsmodell ved skolen i Fredriksvern, er den nøyaktig gjennomført i rigging, og dermed til stor glede for dagens modellbyggere som søker kunnskap.

Skip, og særlig seilskip, har alltid vært et yndet motiv for malere. Museet har derfor god dokumentasjon av seilende krigsskip sett gjennom kunstneres øyne. Seilkrigsskipenes dekorasjon i form av skulpturerte gallionsfigurer er også representert, sammen med statuer av vår gamle sjøhelt Tordenskjold.

Museet har blant annet verdens første torpedobåt, Rap fra 1873, og en tysk en-mannsubåt fra 2. verdenskrig hvor luken ikke kan åpnes innenfra. Kanoner av jern med runde kuler fra krigen mot England i 1807 finnes også, sammen med skyts fra senere tider. Et enormt fregatt-anker fra 1797, gangspillet fra fregatten Desideria i 1851, og deler av masten fra dampkorvetten Nordstjernen- sjøsatt i 1862, er plassert utendørs. Torpedobatteriet fra jegeren Stord, som åpnet ild mot slagskipet Scharnhorst 2. juledag i 1943, er det også mulig å ta i nærmere øyesyn.

Ved skriftlig henvendelse per e-mail, telefaks eller brev kan museet være behjelpelig med kopier av tegninger og annen dokumentasjon i den grad det er mulig.