Marinemuseet i Horten er blitt kalt verdens eldste marinemuseum. Det ble opprettet ved en Kongelig Resolusjon av 5. oktober 1853. Andre lands mariner hadde på denne tiden samlinger av modeller og gjenstander, men de var ikke tilgjengelig for publikum og altså ikke egentlig museer.

Museets første lokaler var på gården Solli i Horten. Dette var boligen til kommandørkaptein C. F. Klinck som hadde donert sin samling til museet. Ved Klincks død i 1860 ble museet flyttet til et skur i det gamle sykehusets have på Karljohansvern. Samlingen ble gitt som gave til den daværende Marinekommandoen. Kommandørkaptein Klinck var en veteran fra krigen mot England (1807-1814), og da Norge kom i union med Sverige, fortsatte han i norsk tjeneste. I årene fremover tjenestegjorde han som skipssjef på flere av våre orlogsskip.Da magasin A var ferdigbygget i 1864, flyttet museet inn i bygningens 2. etasje. I dag kalles denne delen av museet for Den gamle avdeling.

Marinemuseet ligger på Marinens gamle hovedbase og har nå store samlinger knyttet til Marinens historie gjennom krig og fred. Mange av gjenstandene er unike i verdenssammenheng.

Samlingen omfatter fartøyer og utstyr knyttet til den norske marinen, alliert og tysk utstyr, fartøymodeller, malerier og bilder for å nevne noe. Dessuten står museet som eier av Shetlandsbussen Hitra, en "subchaser" som gjorde tjeneste mellom Shetland og Norge fra 1943 til krigen var over og deretter i Norge fram til 1954.

Sommeren 1998 fikk museet en verdifull tilvekst til utstillingen i form av en Kobben-klasse undervannsbåt, MMU Utstein, som er tilrettelagt for publikum og montert utenfor museet.

I tillegg har museet en MTB i Stormklassen, MMU Blink, liggende på vannet ved siden av Museet som også er åpen for publikum.

På 1980-tallet, samtidig med Marinemuseets store ekspansjon i areal, ble Marinens Bibliotek overført til museet. Boksamlingene har sin opprinnelse i Fredriksvern i 1805, men ble i 1854 overført til Horten. Marinens Bibliotek er i dag slått sammen med Marinemuseets boksamlinger. Til sammen utgjør boksamlingen ca. 25.000 enheter, hvorav 12.000 bind militær faglitteratur. Marinemuseet har også samlet fartøyenes loggbøker fra 1814 og frem til i dag, en uvurderlig dokumentasjon i forskningssammenheng. Museet får jevnlig skips- og konstruksjonstegninger, og disse blir nå registrert. I løpet av de siste 5 årene er også et reglementsarkiv på ca. 4.500 enheter som dekker perioden fra ca. 1750 til i dag katalogisert.