Det faktum at Kystvakten har blitt tildelt oppgaver og en plikt til å ha et samarbeid med andre statlige myndigheter fører til at Kystvakten må forholde seg daglig til disse. Samvirke med disse etatene er regulert i samarbeidsavtaler. Målet med kystvaktloven er å sørge for en helhetlig regulering av Kystvaktens organisasjon, ansvar og myndighet, og en mest mulig effektiv utnyttelse av statens samlede ressurser i kystfarvannene og i havområdene utenfor. Et tett og godt samarbeid med primærmyndighetene er derfor nødvendig for å oppnå Stortingets intensjoner ved opprettelsen av Kystvakten.