Samarbeidsforumet ledes av et styre på ni representanter. Fem av disse, inkludert leder, er fra medlemsbedriftene. To studentmedlemmer velges av studentene selv. Fakultetets dekanus og direktør er ex officio - medlemmer av styret.
Styret tilsetter en koordinator for Samarbeidsforumets virksomhet. Koordinatoren lønnes på timesbasis etter særskilt avtale. Sekretariatsfunksjonen ivaretas av administrasjonen ved Fakultetet for naturvitenskap og teknologi, NTNU.
I 2008 vil Samarbeidsforum ha følgende styrerepresentanter: