Innen det 2-årige masterstudiet er det kun mulig å ta fordypning Tilpassede datasystemer. Studenter som tas opp til det 2-årige masterstudiet i Teknisk kybernetikk, og som ønsker å ta fordypning Medisinsk kybernetikk eller Fiskeri og havbrukskybernetikk, kan bare få dette ved å bruke ett år ekstra studietid, det vil si frivillig starte på nivå med 3. årskurs i det 5-årige masterstudiet i Teknisk kybernetikk.
Studieretning Reguleringsteknikk
Fordypninger:
Prosesskybernetikk
Navigasjon, fartøystyring og robotteknikk
Begge disse fordypningene kan velges innenfor det 2-årige masterstudiet.