Alle institutt har et fagutvalg. På IHA består fagutvalget av den tillitsvalgte fra hver klasse, leder i Akvastud og Husdyrklanen, studentrepresentantene i instituttstyret, undervisningsutvalget , forskningsutvalget og programmutvalget for akvakultur. Fagutvalget tar opp saker som kommer fra studentene i de ulike klassene og bringer disse videre, og informerer studentene om hva som skjer oppover i systemet.