Marie Lundbæk
Prosjektmedarbeider
Studier av mikroRNA (miRNA) i prostatakanserceller
Studien skal kartlegge miRNA-status i tre cellelinjer (PC-3, DU-145 og LNCaP) etablert fra prostatakarsinom. Cellelinjene er isolert fra henholdsvis en beinmetastase, en hjernemetastase og en lymfeknutemetastase. Fenotypisk er de nokså forskjellige med hensyn på aggressiv atferd, og det er derfor viktig å få kartlagt miRNA-status til disse mye brukte cellelinjene. Metodisk vil miRNA-matriser levert av mikroarrayplattformen i Trondheim bli benyttet. Dataanalyser bistås av bioinformatikkmiljøet på Gløshaugen. Verifisering av resultater vil bli gjort ved hjelp av PCR-teknikker.

Helena Bertilsson
Stipendiat
Nye prognostiske markører ved prostatacancer
Gleason grad er et histologisk bilde som forteller noe om prognosen ved cancer prostata. Gleason grad 4 har vesentlig dårligere prognose enn gleason grad 3. Det er derfor av stor betydning å forstå de basale mekanismene i ulike gleasongraderinger. Prosjektet har som mål å finne hvilke molekylære og genetiske forskjeller som finnes i gleason grad 3 og grad 4. Immunohistokjemi blir brukt ved analyse av proteinuttrykk. Mikromatriser (Affymetrix) på mikrodissekert materiale blir analysert mht genekspresjon.

Åse Kristin Skain Andersen
Mastergradstudent
Nedregulering av E-cadherin med siRNA: endringer i invasivitet og proteinuttrykk
Nedsatt uttrykk av det epiteliale adhesjonsmolekylet E-cadherin er vanlig ved prostatakreft. Jeg vil nedregulere E-cadherin i lite invasive prostataceller (LNCaP) ved å bruke RNA interferens, og se om cellenes invasive egenskaper øker. I tillegg vil jeg studere hvilken effekt nedsatt ekspresjon av E-cadherin har på proteiner involvert i epitelial-mesenchymal-transisjon (EMT). EMT er en prosess hvor epitelceller får en mer mesencymal fenotype, og som kan være assosiert med kreftutvikling.

Dersom nedregulering av E-cadherin induserer EMT og øker de invasive egenskapene hos kreftcellene, fremmes spørsmålet om E-cadherin kan være et fremtidig medikament for å hindre utvikling av prostatakreft.

Anette Hansen
Mastergradstudent
Etablering av infiltrasjonsmodell egnet for ultrastrukturelle studier
Invasjonsmodeller som forskningsgruppen har benyttet tidligere, har den ulempen at ultrastrukturelle studier er teknisk vanskelig å utføre. Jeg arbeider derfor med å utvikle en 3D-invasjonsmodell med utgangspunkt i collage-gel. Gelens tetthet må tilpasses den enkelte cellelinjes evne til å invadere. Modellen skal kunne brukes også i cokultur-studier. Lys- og elektronmikroskopiske metoder benyttes for å dokumentere cellenes struktur i og på gelen.

Marius Dybwad
Mastergradstudent
Genekspresjonsanalyser på prostatakreftceller samdyrket med osteoblaster
Genekspresjonsanalyser ved hjelp av Affymetrix® Microarray på bakgrunn av in vitro co-kulturmodell mellom prostatakreftcellelinjer (PC-3, DU145, LNCaP) og humane føtale osteoblaster (hFOB1.19). Studien ønsker å relatere eventuelle genekspresjonsendringer opp mot mekanismene bak etablering og progresjon av skjelettmetastaser av prostatakreft. Kartlegging av interaksjonene mellom prostatakreftceller og beinvevsmiljøet kan peke ut interessante områder for videre studier og til slutt avdekke potensielle angrepspunkter for nye behandlingsmetoder av skjelettmetastaser.

Arsalan Moghen
Mastergradstudent
Faktorer som influerer på RNA-kvalitet i nedfryst vevsmateriale. En undersøkelse av biopsier fra rottelever
En utfordring i biobanksammenheng er behandling av vevet ved forskjellige trinn fra tiden prøvematerialet er tatt til det lagres, og dette vil variere i stor grad ved forskjellige laboratorier. Dette kan ha betydning for RNA-integritet og ekspresjonsnivå av m-RNA og kan derfor påvirke resultatet av genekspresjonsstudier. Dette er spesielt viktig fordi molekylære verktøy for vevsprofilering med genteknologiske metoder krever vevsmateriale med høy RNA-kvalitet.

Formålet med denne studien er å oppklare forskjellen ved bruk av ulike innsamlings- og lagringsmetoder, samt å finne ut hvilken betydning RNA-kvalitet virkelig har for genteknologiske metoder som real-time PCR og mikromatrise. Kunnskapen forsøket genererer kan være nyttig for å optimalisere prosedyrer for samling av biopsier ved biobankene.

Kristina Berg Lorvik
Mastergradstudent
Optimalisering av metoder for genekspresjonsanalyser på vevsmateriale fra prostata
Denne masteroppgaven har konsentrert seg om optimalisering og standardisering av metoder knyttet til genekspresjonsanalyser på prostatamateriale. Teknikker som laser-mikrodisseksjon (for å skaffe til veie homogene cellepopulasjoner) og polymerase kjede reaksjon og in vitro-transkripsjon (for amplifisering av RNA) har blitt undersøkt. For selve genekspresjonsanalysene har mikromatriser fra Affymetrix blitt benyttet. RNA, både i henhold til utbytte og kvalitet, har blitt viet mye oppmerksomhet, da det tidligere har vist seg at det er svært variabelt hva man kan forvente av prostatavevet. Optimalisering og standardisering av metoder vil trolig gi bedre korrelasjon mellom genekspresjonsstudier og gjøre det lettere å utveksle biologisk informasjon verden rundt.

Kristen Hammervold
Forskerlinjestudent
Urokinase plasminogenaktivator og invasivitet i prostatacarcinomceller
Urokinase plasminogenaktivator (uPA) er en ekstracellulær protease som er knyttet til invasiv atferd i kreft. I denne studien brukes cellelinjer av prostatacarcinom som modell. uPA-produksjonen nedreguleres ved hjelp av RNA-interferens, og effekten av redusert uPA-sekresjon måles i invasjonskammerforsøk, hvor invasiv evne kvantifiseres ved å telle hvor mange celler som er i stand til å bryte gjennom en rekonstituert basalmembran i løpet av en gitt tid.