Masteroppgave i mikrobiologi - tema C

Studieveilederen

Microorganisms can be found almost everywhere, even in the most hostile environments on Earth where no other organisms can live, and they represent an overwhelming biodiversity.

Kontaktperson: Åsa Frostegård, IKBM

The rapid development of molecular methods is providing us with fantastic tools for a better understanding of the key roles that microorganisms play in natural environments, and to examine this biodiversity for a range of biotechnological purposes.
Microorganisms can degrade almost any type of organic compounds, and can therefore be used for bioremediation of polluted soil and water, for composting and for production of biogas. The development of more efficient strains of symbiotic microorganisms such as nitrogen fixing bacteria and mycorrhizal fungi are interesting alternatives to chemical fertilizers within agriculture and forestry, and the use of microorganisms for biocontrol may reduce the need for pesticides.

Other challenges for microbial ecologists today include a better knowledge concerning the spread and establishment of “new” pathogenic organisms, or of genetically modified microorganisms and their genes. Moreover, the so called “metagenome”, meaning the huge reservoir of hitherto unknown microbial genes, is now starting to be explored for development of new pharmaceuticals, anti-cancer drugs, and enzymes for use in various industrial processes.

Vi har prosjekt innen flere av disse områdene. På neste side følger noen eksempler hvor det finnes passende hovedfagsoppgaver. Kom gjerne og diskutere!!

1. Funksjonell genomikk och genregulering hos denitrifiserende bakterier – kontroll av klimagassutslipp
Bakteriell reduksjon av oksiderte nitrogen (denitrifikasjon) er en biogeokjemisk nøkkelfunksjon og den eneste prosessen som fører biologisk aktive nitrogenforbindelser tilbake til atmosfæren. Lystgass er et mellomprodukt i denne reduksjonsprosessen, og terrestriske økosystem utgjør den største enkeltkilden til utslipp av lystgass til atmosfæren. I dette prosjektet studerer vi hvordan emisjon av lystgass reguleres via regulering av enzymaktivitet og genregulering hos de denitrifiserende bakteriene i jord.

2. Spredning av genetiskt modifiserte mikroorganismer
Bruken av genetiskt modifiserte organismer øker, men det eksisterer berettiget usikkerhet om farene ved at disse organismene kommer ut i naturen, og at deres gener spres til andre organismer. Bakterier utveksler genetisk informasjon gjennom opptak av DNA fra nært beslektede organismer, men også fra helt ulike. Det er for eksempel nylig vist at gener fra transgene planter kan tas opp av bakterier i rhizosfæren, integreres og uttrykkes av disse. Innen dette prosjektet studerer vi faktorer som spiller rolle for om fremmende gener etableres og spres i bakteriesamfunn i naturen.

3. Diversitet og effektivitet hos nitrogenfikserende bakterier fra tropiske områder
Belgvekster er viktige komponenter i tropiske jordbrukssystemer. I tillegg til å produsere mat, fôr, tømmer, ved og annet, beriker de jorda ved biologisk nitrogenfiksering (BNF). Denne biologiske nitrogenfikseringen uttrykkes gjennom symbiose med rhizobier, jordboende bakterier som har evne til å infisere og danne knoller på røtter og stengler hos belgvekstene. Men BNF påvirkes av flere variabler, både i de symbiotiske partnerne og i miljøet. Dessuten kan potensialene bare realiseres fullt ut hvis belgvekstene blir infisert av effektive rhizobier. Innen dette prosjektet studerer vi artsdiversitet og fylogeni hos rhizobier som vi isolerer fra forskjellige leguminoser. Våre resultater så langt viser at Etiopia er et viktig senter for rhizobium-diversitet og et lovende område for oppdagelse av hittil ukjente rhizobium-arter.



Oppdatert: 10.02.05
Utskriftsvennlig versjon : Arkiv : Tips en venn