Patentstyret
Patentstyret
Kapittel II Innholdet i patentsøknaden, unntatt kravene
Patentretningslinjene Del C: Realitetsbehandling

1. GENERELT
 
2. BENEVNELSEN (tittelen)

3. BESKRIVELSEN 
 3.1 Tydelighet 
 3.2 Beskrivelsens alminnelige del 
  3.2.1 Innhold 
  3.2.2 Ikke-nødvendige referanser til kjent teknikk 
  3.2.3 Beskrivelse av oppfinnelsens problem og løsning 
 3.3 Beskrivelsens spesielle del 
  3.3.1 Figurfortegnelse 
  3.3.2 Overensstemmelse mellom beskrivelse og tegninger
  3.3.3 Angivelse i beskrivelsen av elementer vist på tegningene 
  3.3.4 Den nærmere forklaring på oppfinnelsen 
  3.3.5 Tilstrekkelig tydelighet 
  3.3.6 Ikke tilstrekkelig tydelighet 
  3.3.7 Industriell utnyttelse 
 3.4. Innholdet generelt 
  3.4.1 Måten og rekkefølgen av fremstillingen i beskrivelsen 
  3.4.2 Tekniske termer 
  3.4.3 Programlister - flytskjema 
  3.4.4 Standarder, størrelser, enheter og symboler 
  3.4.5 Produktnavn 
  3.4.6 Registrerte varemerker 
  3.4.7 Henvisninger til andre dokumenter

4. TEGNINGER 
 4.1 Form og innhold 
 4.2 Offsetreproduksjon 
 4.3 Fotografiske gjengivelser

5. SAMMENDRAGET

6. OPPFINNELSER SOM GJELDER ELLER ANVENDER BIOLOGISK MATERIALE 
 6.1 Definisjoner 
 6.2 Allmenn tilgjengelighet for biologisk materiale 
 6.3 Deponering 
  6.3.1 Ny deponering 
  6.3.2 Deponeringsinstitusjoner 
 6.4 Beskrivelse av deponert biologisk materiale 
 6.5 Utlevering av deponert biologisk materiale

7. MATERIALE SOM IKKE BØR INNTAS I SØKNADEN 
 7.1 Erklæringer eller annet materiale som går i mot sedelighet eller offentlig orden. 
 7.2 Erklæringer av nedsettende art vedrørende andres produkter eller prosesser. 
 7.3 Erklæringer som åpenbart er irrelevante eller unødvendige.

8. VEDLEGG 
8.1 RETNINGSLINJER FOR ANGIVELSE AV NUKLEOTID- OG/ELLER AMINOSYRESEKVENSER. SEKVENSLISTER.  
  8.1.1 Innledning 
  8.1.2 Definisjoner 
  8.1.3 Sekvenslister generelt 
  8.1.4 Nukleotidsekvenser (eksempel gis i 8.1.10) 
  8.1.5 Aminosyresekvenser (eksempel gis i 8.1.10) 
  8.1.6 Annen tilgjengelig informasjon i sekvenslisten 
  8.1.7 Etterinnlevering av sekvenslister 
 8.1.8 Maskinlesbar form 
  8.1.9 Standardoppsett og tabellsamling 
  8.1.10 Eksempelsamling 
   
  

1. GENERELT

PF § 2
En søknad om patent skal inneholde:

  1. et særskilt søknadsskriv
  2.  en beskrivelse av oppfinnelsen, eventuelt med tegninger
  3.  en bestemt angivelse av hva som søkes beskyttet ved patentet (patentkrav) (se kap. III)
  4.  et sammendrag.


2. BENEVNELSEN (tittelen)

PB § 1-1, nr. 3

Beskrivelsen innledes med en kort og saklig benevnelse på den oppfinnelse som søkes patentert. Fantasibetegnelser skal ikke anvendes. Benevnelsen må ses på i lys av beskrivelsen og kravene og eventuelle endringer i disse, slik at den gir en klar og tilstrekkelig beskrivelse av oppfinnelsen. Dersom kravkategoriene endres, må en tilsvarende endring i benevnelsen foretas. Endring i benevnelsen kan utføres av saksbehandler dersom ordlyden i kravene følges.
 

3. BESKRIVELSEN

PL § 8, annet ledd

3.1 Tydelighet

Beskrivelsen skal være så tydelig at en fagmann på grunnlag av denne skal kunne utøve oppfinnelsen, jf PL § 8, 2. ledd. Det må her ses på søknaden som helhet, inkludert beskrivelsen, kravene og eventuelle tegninger. "Fagmannen" vil i denne henseende antas å være en gjennomsnittspraktiker som ikke bare kjenner til innholdet av søknaden som sådan og referansene i denne, men også til hva som var alminnelig kunnskap på området på inngivelsesdagen (se IV, 5.6). Vedkommende antas å ha hatt til rådighet de vanlige midler og ha hatt evner til å utføre rutinearbeid og eksperimentering som er normale for det aktuelle tekniske felt. Som "alminnelig kunnskap" kan det generelt tas i betraktning den informasjon som finnes i grunnleggende håndbøker, særavhandlinger og lærebøker på området (se T 171/84, OJ 4/1986, 95). Unntaksvis kan det også bety innholdet i patentskrifter og vitenskaplige publikasjoner, dersom oppfinnelsen er på et område som er så nytt at relevant teknisk kunnskap ennå ikke er tilgjengelig fra lærebøker (se T 51/87, OJ 3/1991, 177).
Bestemmelser rettet på beskrivelsens innhold er regulert i PL § 8, annet ledd, tredje setning, og PB § 2-1. Hensikten med disse bestemmelsene er å:

(i) sikre at søknaden inneholder tilstrekkelig teknisk informasjon til at fagmannen kan utøve oppfinnelsen i det omfang som kreves beskyttet, og

(ii) gjøre leseren i stand til å forstå hva som er oppfinnelsen ifølge patentkravenes bidrag til teknikkens stilling.

3.2 Beskrivelsens alminnelige del

PB § 2-1, nr. 1

PB § 2-4, første ledd

3.2.1 Innhold

Anvendelsesområdet for oppfinnelsen skal angis, fortrinnsvis i innledningen til den alminnelige del. Beskrivelsen bør ved inngivelsen også angi den kjente teknikk som søkeren kjenner til, og som kan være nyttig for forståelsen av oppfinnelsen og dens forhold til teknikkens stilling. Da bør fortrinnsvis henvisninger til litteratur og særlig patentlitteratur som omtaler nevnte kjente teknikk inkluderes. Dette gjelder særlig kjent teknikk som svarer til den innledende del av det eller de selvstendige krav (se III, 2.2.1).

Referanser til dokumenter som kommer til på et senere stadium, f eks gjennom granskningsrapporten, må inntas når dette er nødvendig for å gi et riktig bilde av oppfinnelsen (se T 11/82, OJ 12/1983, 479). Eksempelvis kan den opprinnelige omtalen av teknikkens stilling gi det inntrykk at oppfinneren har utviklet oppfinnelsen fra et bestemt punkt, mens de senere fremtrukne dokumenter kan vise at visse trinn eller aspekter ved den påståtte oppfinnelsen allerede var kjent. I et slikt tilfelle skal det inntas en referanse til disse dokumenter sammen med en kort omtale av den relevante delen av innholdet. Inntak av en slik omtale vil ikke stride mot PL § 13, idet denne paragrafen kun refererer til det som har med selve oppfinnelsen å gjøre.

Omtalen av nevnte dokumenter tilkommet etter inngivelsesdagen må være saklig. Påståtte fordeler ved oppfinnelsen må om nødvendig korrigeres i lys av kjent teknikk. Nye påstander om fordeler kan inntas dersom det er grunnlag for det i basisdokumentet.

Hvis kjent teknikk er en norsk søknad, inkludert videreførte internasjonale søknader, som referert til i PL § 2.2.2, må dette fremgå av omtalen av dokumentet, slik at det er klart at det ikke gjelder et dokument som det forlanges oppfinnelseshøyde overfor (se IV, 5.1).

3.2.2 Ikke-nødvendige referanser til kjent teknikk

Ettersom leseren antas å ha teknisk bakgrunnskunnskap på det angjeldende område, er det ikke nødvendig at søkeren inntar avhandlinger, forskningsrapporter eller lignende som omhandler ting som er kjent fra lærebøker eller er velkjent på annen måte. Det er heller ikke nødvendig med en detaljert omtale av dokumentene som utgjør kjent teknikk. Det er tilstrekkelig å indikere hvorfor det er referert til nevnte dokumenter, med mindre en mer detaljert beskrivelse er nødvendig for den fulle forståelse av oppfinnelsen (se også II, 3.4.7). Lister med ulike dokumenter som angår det samme trekk eller aspekt ved oppfinnelsen er ikke nødvendig; det er tilstrekkelig å referere til det mest relevante. På den annen side behøver ikke slike lister tas ut, med mindre de er svært omfattende (se II, 7.3).

3.2.3 Beskrivelse av oppfinnelsens problem og løsning

PL § 8, annet ledd, tredje setning

PB § 2-1.1.

PB § 2-4

Oppfinnelsen slik den kreves vernet i kravene, må være beskrevet på en slik måte at det tekniske problem eller problemene den angår, blir klargjort og løsningen blir forstått. For å oppfylle dette vilkåret, bør bare slike opplysninger tas med som er nødvendig for å belyse oppfinnelsen. I tilfeller hvor gjenstanden i et uselvstendig krav enten kan bli forstått ved ordlyden i selve kravet eller ved beskrivelsen av en måte å utøve oppfinnelsen på, vil det ikke være nødvendig med tilleggsforklaring av denne gjenstanden. En omtale i beskrivelsen om at en spesiell utførelsesform av oppfinnelsen er angitt i det uselvstendige kravet, vil i så fall være tilstrekkelig. Der hvor den oppfinneriske innsatsen ligger i å erkjenne hva problemet er, se IV, 5.3.a, bør dette fremgå, og hvis midlene for å løse problemet (etter at det er erkjent) er åpenbare, kan opplysninger om dets løsning være minimal i praksis. Når det imidlertid finnes tvil om enkelte opplysninger er nødvendige, bør ikke saksbehandleren insistere på at de fjernes. Det er dessuten ikke nødvendig at oppfinnelsen presenteres eksplisitt i problem- og løsningsform.

Enhver fordelaktig virkning som søkeren anser at oppfinnelsen har i forhold til tidligere kjent teknikk, bør oppgis, men dette bør ikke gjøres slik at det nedvurderer et spesielt tidligere kjent produkt eller fremgangsmåte. Videre bør verken den tidligere kjente teknikk eller søkerens oppfinnelse nevnes på en måte som kan virke villedende. Dette kan f eks oppstå ved en fordekt presentasjon som gir inntrykk av at tidligere kjent teknikk hadde løst mindre av problemet enn det som faktisk var tilfellet. Rettvise kommentarer, som nevnt i II, 7.2, er imidlertid tillatt. Når det gjelder endring eller tillegg i en problemangivelse, henvises det til VII, 3.2.3.

3.3 Beskrivelsens spesielle del

PB § 2-1.2

3.3.1 Figurfortegnelse

PB § 2-1.2, siste ledd

Dersom det finnes tegninger, bør det inntas en figurfortegnelse som innledning til beskrivelsens spesielle del, og kort beskrivelse på en måte som f eks: "Figur 1 er et grunnriss av transformatorhuset; Figur 2 er et sideriss av huset; Figur 3 er et enderiss sett i retning av pilen 'X' på Figur 2; Figur 4 er et snitt langs linjen AA på Figur 1".

3.3.2 Overensstemmelse mellom beskrivelse og tegninger

Beskrivelsen og tegningene bør være i overensstemmelse med hverandre, også når det gjelder referansenummer og andre tegn, og hvert nummer eller tegn må være forklart. Hvor det som følge av endringer i beskrivelsen må slettes hele avsnitt, kan det imidlertid være omstendelig å slette alle de overflødige henvisningsbetegnelsene fra tegningene, og i slike tilfeller bør saksbehandleren ikke gjøre innvendinger, jf PB § 17-12, siste setning. Den omvendte situasjon må aldri forekomme, dvs at alle henvisningstall eller -tegn som brukes i beskrivelsen eller kravene må også fremkomme på tegningene.

3.3.3 Angivelse i beskrivelsen av elementer vist på tegningene

Når det i beskrivelsen er nødvendig å referere til elementer på tegningene, bør navnet og henvisningsbetegnelsen på elementet angis, dvs at referansen ikke skal være på formen: "3 koplet til 5 via 4", men: "motstand 3 er koplet til kondensator 5 via bryteren 4".

3.3.4 Den nærmere forklaring på oppfinnelsen

PL § 8, annet ledd, tredje setning

PF § 18, første setning

PB § 2-1.2

Det må gis en detaljert beskrivelse av minst én måte å utføre oppfinnelsen på. Siden søknaden henvender seg til en fagmann, er det verken nødvendig eller ønskelig at detaljer omkring velkjente hjelpetrekk oppgis, men beskrivelsen må angi ethvert trekk som er vesentlig for å utføre oppfinnelsen i tilstrekkelig detalj for å gjøre det opplagt for fagmannen hvordan oppfinnelsen kan settes ut i praksis. Et enkelt utførelseseksempel eller en enkel utførelsesform kan være tilstrekkelig, men dersom kravene dekker et bredt felt, bør søknaden vanligvis ikke anses å oppfylle vilkåret ifølge PL § 8, annet ledd, tredje setning, med mindre beskrivelsen  gir et antall eksempler eller beskriver alternative utførelsesformer eller variasjoner som spenner over hele området beskyttet av kravene. Imidlertid må det tas hensyn til fakta i hvert enkelt tilfelle. Det finnes tilfeller hvor selv et svært bredt felt er tilstrekkelig eksemplifisert av et begrenset antall eksempler eller bare ved ett eksempel (se også III, 5). I disse tilfellene må søknaden, i tillegg til eksemplene, inneholde tilstrekkelige opplysninger til at en fagmann, ved hjelp av sin generelle kunnskap, kan utføre oppfinnelsen over hele området som kreves beskyttet, uten unødige anstrengelser og uten å behøve oppfinneriske ferdigheter (se T 727/95, OJ 1/2001, 1). Hvis saksbehandler er i stand til å begrunne at søknaden mangler tilstrekkelig tydelig beskrivelse av oppfinnelsen, vil ansvaret for å påvise at oppfinnelsen kan utøves og reproduseres over hele beskyttelsesområdet ligge på søkeren.

For at vilkårene ifølge PL § 8, annet ledd, tredje setning og PB § 2-1 skal fullt ut oppfylles, er det nødvendig at oppfinnelsen blir beskrevet både ved dens oppbygning og ved dens funksjon, med mindre funksjonen til de forskjellige delene umiddelbart fremgår. Faktisk kan en tydelig beskrivelse av funksjon innen enkelte tekniske områder (f eks datamaskiner) være mye mer hensiktsmessig enn en overdetaljert beskrivelse av oppbygningen.

3.3.5 Tilstrekkelig tydelighet

PL § 8, annet ledd, tredje setning

PL § 8a

Det er søkerens ansvar å sikre at det ved første gangs inngivelse av søknaden innleveres en tilstrekkelig beskrivelse, dvs en beskrivelse som oppfyller vilkåret i PL § 8, annet ledd, tredje setning, når det gjelder oppfinnelsen som kreves vernet i alle kravene. Hvis kravene definerer oppfinnelsen eller et trekk ved denne ved hjelp av parametere (se III, 4.6.1), må den først inngitte søknaden omfatte en tydelig beskrivelse av hvilke metoder som brukes for å bestemme parameterverdiene. Dette gjelder likevel ikke dersom en fagmann vil vite hvilken metode som skal brukes eller dersom alle metodene vil gi samme resultat (se III, 4.6.1).

Hvis beskrivelsen er svært utilstrekkelig, vil denne mangelen ikke kunne rettes opp etter inngivelsesdagen ved å tilføye ytterligere eksempler eller trekk, uten å stride mot PL § 13 (se VII, 3). Derfor må søknaden i slike tilfeller normalt avslås. Hvis imidlertid mangelen oppstår bare for enkelte utførelsesformer av oppfinnelsen og ikke andre, kan dette rettes opp ved å begrense kravene, slik at de bare svarer til de tilstrekkelig beskrevne utførelsesformene, og at beskrivelsen av de gjenværende utførelsesformene slettes.

3.3.6 Ikke tilstrekkelig tydelighet

Det forekommer at det inngis søknader hvor det finnes en fundamental utilstrekkelighet i oppfinnelsen, ved at den ikke kan utføres av en fagmann. Det vil da foreligge en mangel på oppfyllelse av vilkåret i PL § 8, annet ledd, tredje setning og som i alt vesentlig er uopprettelig. To tilfeller av dette krever spesiell omtale:

a) Det første tilfellet er når den vellykkede utførelse av oppfinnelsen er avhengig av omstendighetene eller er tilfeldig. Det vil si at fagmannen ved å følge instruksene for å utføre oppfinnelsen, enten finner at de påståtte resultatene av oppfinnelsen ikke kan repeteres, eller at vellykkede resultater oppnås på en helt upålitelig måte.

Et eksempel på hvor dette kan oppstå, er en mikrobiologisk prosess som innebærer mutasjoner.

Et slikt tilfelle må skilles fra et tilfelle hvor gjentatt vellykkethet er sikret, selv om det medfølger en andel feilforsøk, noe som f eks kan oppstå ved fremstilling av små magnetiske kjerner eller elektroniske komponenter. I sistnevnte tilfelle vil ingen innvending oppstå under PL § 8, annet ledd, tredje setning, forutsatt at de tilfredsstillende delene lett kan sorteres ved hjelp av en ikke-destruerende prøvemåte.

b) Det andre tilfellet er hvor en vellykket utførelse av oppfinnelsen er iboende umulig på grunn av at det vil stride mot aksepterte fysiske lover - dette gjelder f eks en evighetsmaskin. Hvis patentkravene for en slik maskin er rettet på dens funksjon, og ikke bare dens oppbygning, vil en innvending ikke bare oppstå under PL § 8, annet ledd, tredje setning, men også under PL § 1, første ledd, om at oppfinnelsen ikke kan utnyttes industrielt (se IV, 3.1).


3.3.7 Industriell utnyttelse

PB § 2-1.1, siste setning

Beskrivelsen skal uttrykkelig angi hvordan oppfinnelsen kan utnyttes industrielt, hvis dette ikke er åpenbart ut fra beskrivelsen av den eller umiddelbart fremgår av oppfinnelsens art (se T 870/04). I betraktning av den brede mening som tillegges uttrykket "som kan utnyttes industrielt" i PL § 1, første ledd (se IV, 3.1), må det i de fleste tilfeller bli forventet at hvordan oppfinnelsen kan utnyttes i industrien vil være selvforklarende, slik at en mer eksplisitt beskrivelse om dette ikke er nødvendig. Men det kan være noen få tilfeller, f eks når det gjelder fremgangsmåter for utprøving, hvor måten for industriell utnyttelse ikke er åpenbar og hvor dette i så fall må tydeliggjøres.

3.4. Innholdet generelt

 

3.4.1 Måten og rekkefølgen av fremstillingen i beskrivelsen

PB § 2-1

Måten og rekkefølgen av fremstillingen i beskrivelsen bør være som angitt i PB § 2-1, dvs som nevnt ovenfor, unntaksvis kan en annen måte eller en annen rekkefølge på grunn av oppfinnelsens art gi en bedre forståelse og en mer gunstig fremstilling. Siden ansvaret for en tydelig og fullstendig beskrivelse av oppfinnelsen ligger hos søkeren, bør saksbehandleren ikke innvende mot fremstillingen, med mindre det foreligger vektige grunner. En viss avvikelse fra vilkårene i PB § 2-1 er akseptabelt, forutsatt at beskrivelsen er tydelig og ryddig, og at alle nødvendige opplysninger er tilstede. For eksempel kan det ses bort fra å måtte angi den krevde oppfinnelsen med slike uttrykk at det tekniske problemet og dets løsning kan bli forstått når oppfinnelsen er basert på en tilfeldig oppdagelse, og den praktiske anvendelsen av oppdagelsen erkjennes som nyttig, eller når oppfinnelsen bryter helt ny mark. Enkelte teknisk enkle oppfinnelser kan også være fullt forståelige med minimal beskrivelse, og bare en liten henvisning til tidligere teknikk.

3.4.2 Tekniske termer

PF § 18

Selv om beskrivelsen bør være tydelig og rett frem, og unngå unødvendig teknisk sjargong, er det akseptabelt å bruke anerkjente termer fra faget. Lite kjente, eller spesielt formulerte tekniske termer, kan tillates, forutsatt at de blir tilfredsstillende definert og at det ikke finnes noen generelt anerkjent ekvivalent. Dette kan utvides til fremmedspråklige termer hvor det ikke finnes noen ekvivalenter på norsk innenfor saksfeltet. Termer som allerede har en etablert betydning, skal ikke tillates brukt til å mene noe annet hvis dette kan forårsake forvirring. Det kan imidlertid være omstendigheter hvor en term berettiget kan lånes fra en analog teknikk. Terminologi og tegn må være konsekvent gjennom hele søknaden.

3.4.3 Programlister - flytskjema

Når det gjelder oppfinnelser på datamaskinområdet, kan ikke beskrivelsen av oppfinnelsen alene være avhengig av programlister i programmeringsspråk. Beskrivelsen skal, som på andre tekniske områder, vesentlig skrives i normalt språk, eventuelt fulgt av flytskjemaer eller andre hjelpemidler for forståelsen, slik at oppfinnelsen kan forstås av en fagmann som ikke anses for å være programmerings-spesialist. Korte utdrag fra programmer som skrives i vanlig benyttede programmeringsspråk, kan aksepteres hvis de tjener til å illustrere en utførelse av oppfinnelsen.

3.4.4 Standarder, størrelser, enheter og symboler

PB § 6-4

Når det henvises til et materiales egenskaper, bør de relevante enheter spesifiseres hvis kvantitative størrelser er involvert. Hvis dette gjøres ved å henvise til en publisert standard (f.eks. en standard for maskestørrelse) og en slik standard er henvist til med et sett initialer eller lignende forkortelse, bør dette bli tilstrekkelig identifisert i beskrivelsen.

Fysiske verdier må uttrykkes i anerkjente, internasjonale enheter.

Mål- og vektenheter angis etter det metriske system eller, hvis de først angis etter et annet system, dessuten etter det metriske system. Temperatur angis i grad celsius eller, i tilfelle der det er alminnelig godtatt, kelvin. Tetthet (densitet) angis i metriske enheter.

Alle verdier som ikke oppfyller dette kravet, må også uttrykkes i enheter som er anerkjent internasjonalt. Verdier i inch/pound-systemet oppfyller generelt ikke kriteriet "anerkjent internasjonalt".

Ved angivelse av matematiske formler, elektriske enheter og enheter for varme, energi, lys og magnetisme bør internasjonal praksis følges. I kjemiske formler bør alminnelig anvendte symboler, atomvekter og molekyl- eller strukturformler anvendes. For øvrig bør bare slike tekniske uttrykk, tegn og symboler anvendes som er vanlig brukt på vedkommende område.

3.4.5 Produktnavn

Bruk av egennavn, varemerker eller varenavn eller lignende ord som henviser til materiale eller artikler er uønsket hvis slike ord bare benevner opprinnelse eller hvor de angår en rekke forskjellige produkter. Hvis et slikt ord brukes, må produktet, hvor dette er nødvendig for å oppfylle kravene i PL § 8, være tilstrekkelig identifisert uten støtte i ordet, slik at oppfinnelsen kan utføres av en fagmann ved inngivelsestidspunktet. Der hvor slike ord er blitt internasjonalt anerkjent som standard-beskrivende termer og har oppnådd en nøyaktig betydning (f.eks. "Bowden"-kabel, "Belleville"-skive, "Panhard"-stang, "Teflon"-lag, "Caterpillar"-belte) kan de tillates uten videre identifikasjon av det produktet de angår.

3.4.6 Registrerte varemerker

Det er søkerens ansvar å påse at registrerte varemerker erkjennes som sådanne i beskrivelsen. Se for øvrig III, 4.5.3.

3.4.7 Henvisninger til andre dokumenter

Henvisninger i patentsøknader til andre dokumenter, kan enten angå bakgrunnsteknikken eller del av oppfinnelsens beskrivelse.

Når referansen angår bakgrunnsteknikken, kan dette skje i den opprinnelig inngitte søknad, eller innføres senere (se II, 3.2.1 og 3.2.2).

Når henvisningen direkte angår oppfinnelsens beskrivelse (f eks opplysninger om én eller flere komponenter i et krevd apparat) bør saksbehandleren først vurdere om det som er kjent i dokumentet faktisk er vesentlig for å utøve oppfinnelsen ifølge PL § 8, annet ledd, tredje setning. Hvis ikke, bør det vanligvis benyttede uttrykket "som herved er inntatt ved referansen", eller et uttrykk av samme type, slettes fra henvisningen i beskrivelsen.

Hvis gjenstanden i dokumentet det er henvist til er vesentlig for å oppfylle bestemmelsene i PL § 8, annet ledd, tredje setning, bør saksbehandleren kreve at dette uttrykkelig innlemmes i beskrivelsen, siden beskrivelsen skal være selvopplysende når det gjelder vesentlige egenskaper ved oppfinnelsen, dvs kunne forstås uten henvisning til noe annet dokument. Slik innlemmelse er imidlertid underlagt følgende restriksjoner (se T 689/90, OJ 10/93, 616):

1) det må ikke stride mot PL § 13 i den betydning at oppfinnelsens beskrivelse som inngitt ikke etterlater en fagkyndige leser i tvil om:

a) at gjenstanden det søkes, eller kan søkes beskyttelse for, omfatter trekk beskrevet i referansedokumentet;

b) at disse trekkene bidrar til å oppnå oppfinnelsens tekniske mål og således er omfattet i løsningen av det tekniske problem som er underliggende for den oppfinnelsen som er gjenstand for søknaden;

c) at disse trekkene i det minste underforstått klart hører til beskrivelsen av oppfinnelsen i søknaden, og således til innholdet i den inngitte søknad; og

d) at slike trekk er nøyaktig definert og identifiserbare innenfor den totale tekniske informasjon i referansedokumentet;


2)
dokumenter som ikke er allment tilgjengelige ved inngivelsesdatoen for søknaden, kan bare vurderes innlemmet når (se T 737/90, ikke publisert i OJ):

a) et eksemplar av dokumentet ble sendt til Patentstyret på eller før søknadens inngivelsesdato; og

b) dokumentet var gjort allment tilgjengelig ikke senere enn på datoen da søknaden ble publisert under PL § 22.

Dersom det i den opprinnelig inngitte søknaden henvises til et dokument, som tjener til å beskrive oppfinnelsen, anses det relevante innholdet i dokumentet å utgjøre en del av søknadens innhold i henhold til PL § 2.2.2. For dokumenter som ikke er allment tilgjengelige før søknadens inngivelsesdato, gjelder dette bare hvis betingelsene (2)(a) og (2)(b) ovenfor oppfylles.

På grunn av denne virkning under PL § 2.2.2, er det svært viktig at når det henvises direkte bare til en bestemt del av det refererte dokument, at denne delen tydelig angis i referansen.


4. TEGNINGER

PB kapittel 5

4.1 Form og innhold

Formaliakrav vedrørende tegningers form og innhold er angitt i PB kapittel 5.

Saksbehandler bør vurdere om tekst på tegninger er absolutt nødvendig, jf PB § 5-2, annet ledd. Dersom det anses for absolutt nødvendig, for en rask og klar fortolkning, kan tegninger som viser skjematiske blokkdiagrammer, flytskjemaer eller elektriske koblingsskjemaer inneholde stikkord for funksjonelle enheter ved komplekse systemer, for eksempel magnetkjernelager eller hastighetsintegrator.

4.2 Offsetreproduksjon

PB § 5-4

Saksbehandler skal sjekke om trykningseksemplaret av tegningene er egnet for offsetreproduksjon. Hvis kvaliteten på de originale tegningene ikke er egnet for trykning skal saksbehandler be søker om nye tegninger med tilfredsstillende kvalitet. Saksbehandler bør i slike tilfeller være oppmerksom på eventuelle utvidelser av søknadsgjenstanden.

4.3 Fotografiske gjengivelser

Vårt regelverk gir ingen eksplisitt bestemmelse om fotografiske gjengivelser men de er allikevel tillatt brukt der det er umulig å få frem det som skal vises på en tegning. Gjengivelsen skal være i sort/hvitt, være direkte reproduserbare og oppfylle gjeldende krav til tegninger, for eksempel papirstørrelse, marger og lignende. Fargegjengivelser skal normalt ikke godtas. Dersom den originale kvaliteten på en gjengivelse, i utgangspunktet, er uegnet for trykning bør saksbehandler allikevel ikke be om nye gjengivelser da risikoen for å støte mot PF § 25 er overhengende. I slike tilfeller skal den utilstrekkelige kvaliteten aksepteres for reproduksjon.


5. SAMMENDRAGET

PF § 22
PF § 68

Sammendraget angår søknaden slik den foreligger i basisdokumentene. Det skal derfor ikke bringes i samsvar med innholdet i det meddelte patentet, selv om dette avviker fra søknaden.

Foreligger det i en internasjonal søknad et sammendrag godkjent av internasjonal nyhetsgranskningsmyndighet, skal dette godtas dersom oversettelsen er korrekt. Sender man ut et skriv med pålegg om korrigering av oversettelsen må dette være uten fotnote, ettersom søknaden i dette tilfellet ikke kan henlegges dersom svar ikke innkommer. Dersom det ikke foreligger sammendrag godkjent av internasjonal myndighet, skal saksbehandler fastsette sammendragets ordlyd.

Er søknaden ikke en videreført internasjonal søknad, kan sammendragets ordlyd fastsettes av saksbehandler, jf PL § 15, eller eventuelt kan søker anmodes om å innsende et endret sammendrag. For ytterligere bestemmelser om sammendraget, se PB kap. 4 og 6.

Sammendraget skal bare tjene som teknisk informasjon. Det har ingen rettsvirkninger og kan ikke tillegges vekt ved tolkningen av patentet, jf PL § 8, tredje ledd. Det kan heller ikke brukes for å begrunne innføring av nytt materiale i beskrivelsen.


6. OPPFINNELSER SOM GJELDER ELLER ANVENDER BIOLOGISK MATERIALE

6.1 Definisjoner

PL § 1, fjerde ledd, tredje punktum

Med biologisk materiale forstås materiale som inneholder genetisk informasjon, og som kan formere seg selv eller kan formeres i et biologisk system.

Med begrepet mikroorganismer menes her enhver encellet cellulær eller ikke-cellulær mikrobiologisk enhet som er i stand til å formere seg eller til å overføre genetisk materiale. Det anses således å omfatte humane celler, plante- og dyreceller, protozoer og encellede alger, sopp og bakterier, vira og plasmider, dvs alle encellede organismer som kan oppdages med mikroskop og som kan oppformeres og manipuleres i laboratoriet, se kapittel IV, 2a.2.1.

6.2 Allmenn tilgjengelighet for biologisk materiale

PL § 8a

PF § 19

Dersom en oppfinnelse gjelder eller anvender biologisk materiale, må det biologiske materialet enten være allment tilgjengelig eller kunne beskrives slik i søknaden at en fagmann på grunnlag av denne kan utøve oppfinnelsen, for at beskrivelsen skal oppfylle kravene i PL § 8, annet ledd.

Saksbehandleren må vurdere om det biologiske materialet kan anses for å være allment tilgjengelig eller om det er beskrevet slik at en fagmann kan utøve oppfinnelsen. Materialet kan være tilgjengelig ved at det kjent for fagmannen, for eksempel slike mikroorganismer som bakegjær eller enkelte plantefrø, det kan være kommersielt tilgjengelig, for eksempel mikroorganismen Bacillus natto, eller det kan være tilgjengelig ved at det er deponert ved en godkjent deponeringsinstitusjon i henhold til Budapestkonvensjonen av 28. april 1977.

For allment tilgjengelige biologisk materiale skal det angis hvordan det kan fremskaffes.

Dersom oppfinnelsen for eksempel angår en renkultur av en isolert naturlig forekommende mikroorganisme, vil deponering kunne være nødvendig for at mikroorganismen skal bli tilgjengelig dersom opprinnelsesstedet til mikroorganismen ikke kan angis nøyaktig. Deponering vil også kunne være nødvendig dersom en modifisert mikroorganismestamme er fremstilt ved en ikke-reproduserbar fremgangsmåte.

6.3 Deponering

PF § 20, første ledd

PF § 18, annet ledd

Hvis en prøve av biologisk materiale er deponert, må saksbehandleren kontrollere om følgende er oppfylt:

  1. en prøve av det biologiske materialet er blitt deponert hos en godkjent deponeringsmyndighet senest den dagen søknaden ble inngitt,
  2. den inngitte søknaden inneholder de relevante opplysningene om det deponerte materialets karakteristika som søkeren kjenner til,
  3. opplysninger om identiteten til deponeringsinstitusjonen og det nummer deponeringsmyndigheten har gitt prøven av det biologiske materialet, har blitt sendt til Patentstyret senest 16 måneder etter inngivelsesdagen eller, dersom prioritet er begjært, den dagen prioritet er begjært fra.

Saksbehandler kan som bevis for at opplysninger som nevnt under punkt 3) er riktige, kreve en kopi av den kvitteringen som deponeringsinstitusjonen har utstedt.

Dersom deponering er foretatt etter søknadens inngivelsesdag, og deponering er nødvendig, kan ikke den påberopte løpedagen godkjennes, med mindre det blir søkt og gitt oppreisning. Dersom deponering er foretatt etter prioritetsdagen, men før søknadens inngivelsesdag, og deponering er nødvendig, skal søker tilskrives og gjøres oppmerksom på at den påberopte prioritet ikke vil kunne godkjennes.

6.3.1  Ny deponering

PL § 8a, annet ledd,

PF § 21

Opphører en prøve av deponert biologisk materiale å være deponert, kan den erstattes av en ny prøve av det samme materialet, hvis deponeringen foretas innen 3 måneder etter at deponenten mottok underretning om at prøven ikke lenger kunne utleveres. Dersom deponenten ikke mottar slik underretning, kan ny deponering foretas inntil 9 måneder etter at Det internasjonale byrå publiserte opplysninger om forholdet.

Innen 4 måneder etter ny deponering, eller innen 16 måneder etter inngivelsesdagen eller, dersom prioritet er begjært, den dagen prioritet er begjært fra, hvis senere, skal deponenten levere en kopi til Patentstyret av den kvitteringen som den nye deponeringsinstitusjonen har utstedt.
 

6.3.2  Deponeringsinstitusjoner

Internasjonale deponeringsinstitusjoner i henhold til Budapestkonvensjonen publiseres i "Guide to the Deposit of Microorganisms under the Budapest Treaty" som er tilgjengelig på WIPO's hjemmesider (http://wipo.int/).

6.4  Beskrivelse av deponert biologisk materiale

PL § 8, annet ledd

PB § 2-3

Søker skal i beskrivelsen angi alle relevante opplysninger om det deponerte materialet som han kjenner til. Relevante opplysninger er opplysninger om materialets klassifikasjon og karakteristika som skiller materialet fra kjent biologisk materiale.

Mikroorganismer og andre organismer skal som regel beskrives på den måte som angis i standardverker på området. Det biologiske materialet skal karakteriseres så utførlig at forveksling med annet biologisk materiale unngås. Søkeren må i den utstrekning han kjenner til for eksempel angi mikroorganismers morfologiske og biokjemiske karakteristika.

Mikroorgansimer og andre organismer som tidligere er beskrevet i allment tilgjengelig skrift ved bruk av en taksionomisk betegnelse, kan karakteriseres ved denne betegnelsen, om nødvendig komplettert med henvisning til litteratursteder der metoden for den systematiske bestemmelse er beskrevet.


Da organismekarakteristikken ikke kan anses å omfatte organismer hvis egenskaper avviker vesentlig fra de angitte karakteristika, kan angivelser som "oppfinnelsen er ikke begrenset til den nevnte organisme, men skal også omfatte mutanter, varianter og rekombinanter av denne" ikke godtas. Mutanter hvis organismekarakteristikk ikke avviker vesentlig fra de angitte karakteristika, kan omfattes dersom organismens vesentlige egenskaper er entydig definert.

Dersom oppfinnelsen angår en eller flere deponerte organismer, skal deponeringsbetegnelsene angis både i søknadens beskrivelse og i kravene.

Forkortelser for mikroorganismer og andre organismer eller kulturmedia er ofte så lite kjente at de bør unngås. Navn og uttrykk bør skrives helt ut, i hvert fall første gang de nevnes i søknaden.

6.5  Utlevering av deponert biologisk materiale

PL § 22, syvende til niende ledd

Enhver har i utgangspunktet rett til å få utlevert en prøve av deponert biologisk materiale når søknaden er blitt allment tilgjengelig. Etter at patentet er meddelt, kan utlevering skje til

enhver som ber om det, uansett om patentet er opphørt eller kjent ugyldig. Slike prøver skal likevel ikke utleveres til noen som i henhold til lov og forskrift ikke har rett til å ha befatning med det deponerte materialet eller til noen hvis befatning med materialet må antas å være forbundet med betydelig risiko.

Før patent er blitt meddelt eller søknaden endelig avgjort, kan søkeren kreve at en prøve bare utleveres til særlig sakkyndig. Dersom søknaden blir avslått eller trukket tilbake, gjelder det samme i en periode på 20 år fra patentsøknadens inngivelsesdag. Foruten sakkyndige som søkeren godtar, skal sakkyndige godkjent av EPO eller et av de nordiske patentverkene, godkjennes.

Begjæring om utlevering av deponert biologisk materiale skal fremsettes til Patentstyret på fastsatt skjema, gjengitt i "Guide to the Deposit of Microorganisms under the Budapest Treaty" (http://wipo.int/), og skal inneholde en erklæring om at angitte begrensninger i bruken av prøven vil bli iakttatt. Kan prøven bare utleveres til særlig sakkyndig, skal sakkyndig avgi erklæringen.

Utleveringsbegjæringen forberedes av den saksbehandler som er tildelt den aktuelle søknaden eller patentet, og den avgjøres i et utvalg bestående av saksbehandler, den ansvarlige for Budapestkonvensjonen og patentfagansvarlig for det bioteknologiske fagområdet. Dersom en i utvalget ikke kan stille, skal avdelingsdirektøren i Patentavdelingen utpeke en stedfortreder.

7. MATERIALE SOM IKKE BØR INNTAS I SØKNADEN

PF § 18

Det finnes tre kategorier av spesifikt materiale som ikke bør inntas i søknaden (se også IV, 6).

7.1 Erklæringer eller annet materiale som går i mot sedelighet eller offentlig orden.

Eksempler på denne kategorien er oppfordring til opptøyer eller ordensforstyrrelser, oppfordring til kriminelle handlinger, rasistisk, religiøs eller annen diskriminerende propaganda og grovt uanstendig materiale. Saksbehandler bør oppfordre til at denne typen materiale strykes i søknaden (Se også IV, 6.1).

7.2 Erklæringer av nedsettende art vedrørende andres produkter eller prosesser.

Det må her skilles mellom ærekrenkende eller lignende nedsettende erklæringer, som ikke er tillatt, og mer rimelige kommentarer. Det er for eksempel tillatt å innta åpenbare eller generelt erklærte svakheter, eller ulemper som hevdes å være oppdaget og som dokumenteres av søkeren, dersom det er relevant for saken.

7.3 Erklæringer som åpenbart er irrelevante eller unødvendige.

PF § 18, første punktum

Denne typen materiale bør utelates dersom den er åpenbart irrelevant eller unødvendig, eksempelvis der materialet ikke har noen relevans vedrørende søknadsgjenstanden eller for angivelsen av teknikkens stilling (se også II 3.2.2). Materiale som bør fjernes kan allerede være åpenbart irrelevant i basisdokumentene eller det kan bli åpenbart irrelevant senere, gjennom realitetsbehandlingen. Eksempelvis kan sistnevnte skje der kravene begrenses til ett av opprinnelig flere alternativer. Når materiale fjernes fra beskrivelsen, må det ikke innlemmes ved henvisning til tilsvarende materiale i den publiserte søknaden eller annen dokumentasjon (se også II, 3.4.7).

8. VEDLEGG


 
8.1 RETNINGSLINJER FOR ANGIVELSE AV NUKLEOTID- OG/ELLER AMINOSYRESEKVENSER. SEKVENSLISTER.
 

8.1.1 Innledning

Foreliggende veiledning har blitt utviklet for at søker skal kunne inngi den samme sekvenslisten i en internasjonal og en videreført internasjonal søknad som i en nasjonal søknad. Veiledningen er i samsvar med WIPO standard ST. 25, og den gjelder for sekvenslister i søknader inngitt i Norge fra og med 1998.07.01

Sekvenslister i henhold til foreliggende retningslinjer kan genereres automatisk ved bruk av spesielt egnede programmer, slik som PatentIn. Patentstyret anbefaler søkerne å benytte et slikt program.

PatentIn og dets brukermanual er fritt tilgjengelig på
www.european-patent-offi e.org/filingsoft/bio_tools/index.htm

8.1.1.1 Gjenstand for sekvenslisten


Sekvenser som omfattes av veiledningen:

  • Uforgrenede sekvenser på ti (10) eller flere nukleotider eller fire (4) eller flere aminosyrer.
  • Peptider og proteiner som kan uttrykkes som sekvenser ved bruk av symbolene i tabell 3, sammen med en beskrivelse et annet sted, for å beskrive for eksempel en kryss-binding, for eksempel en disulfidbro, omfattes også av veiledningen.

Sekvenser som ikke omfattes av veiledningen:

  • Forgrenede sekvenser, sekvenser med færre enn ti (10) spesifikt definerte nukleotider eller fire (4) aminosyrer.
  • Sekvenser inneholdende nukleotider eller aminosyrer andre enn de som er angitt i tabell 1-4. Aminosyresekvenser som inneholder en eller flere D-aminosyrer omfattes derfor ikke.


8.1.2 Definisjoner

For denne veiledningen gjelder:

(i) "sekvenslister" er deler av søknadens beskrivelse som gir en detaljert beskrivelse av nukleotid- og/eller aminosyresekvenser og annen tilgjengelig informasjon knyttet til de aktuelle sekvensene.

(ii) "nukleotider" omfatter bare nukleotider som kan angis ved bruk av symbolene i tabell 1. Modifiseringer skal beskrives ved bruk av symbolene i tabell 2, men utelukkende under egenskapene til sekvensen (i feltet <200>), og ikke i selve sekvensen (feltet <400>).

(iii) "aminosyrer" er L-aminosyrer som inngår i naturlig forekommende proteiner og som er angitt i tabell 3. Modifiseringer skal beskrives ved bruk av symbolene i tabell 4, men utelukkende under egenskapene til sekvensen (i feltet <220>), og ikke i selve sekvensen (feltet <400>).

(iv) "sekvensidentifikasjonsnummeret" er det nummeret som hver sekvens tildeles. Nummeret korresponderer til det "SEQ ID NO" som benyttes ved henvisning til sekvensene i beskrivelsen, kravene og sammendraget.

(v) "identifikasjonsnummeret" er et tresifret tall som representerer et spesifikt dataelement, for eksempel <110> "Søkerens navn".

(vi) "språk-nøytralt vokabular" er en bestemt terminologi som benyttes i sekvenslistene, og som representerer vitenskapelige termer foreskrevet av sekvensdatabaseleverandører og samsvarer med symbolene angitt i tabellene 1-6.

(vii) "fritekst" er en beskrivelse av sekvenskarakteristika under identifikasjonsnummeret <223> "Annen informasjon" og som ikke er begrenset til bruk av "språk nøytralt vokabular" (II, 8.1.2 (vi)).

(viii) "dataelement" er en nummerert angivelse av hva slags informasjon linjen (eller feltet) inneholder.

8.1.3 Sekvenslister generelt

Sekvenslisten skal, når den inngis sammen med søknaden, plasseres sist i søknaden og innledes på en ny side med overskriften "SEKVENSLISTE". Sekvenslisten skal fortrinnsvis ha uavhengig sidenummerering. Sekvenslisten utgjør en integrert del av beskrivelsen, og det er derfor unødvendig, med unntak av oversettelse av fritekst (se II, 8.1.6.4), å beskrive sekvensene andre steder i beskrivelsen.

Hvis sekvenslisten ikke inngis samtidig med resten av søknaden, men inneleveres senere som et separat dokument, skal dokumentet benevnes "Sekvensliste", og den skal ha en uavhengig sidenummerering. Den originale nummereringen av sekvensene i søknaden skal beholdes i den senere inngitte sekvenslisten.

Hver sekvens skal bli tildelt et separat sekvensidentifikasjonsnummer. Sekvens-identifikasjonsnummereringen skal begynne med 1 og øke med hele tall i nummerisk rekkefølge. Hvis en sekvens ikke er sekvensert, kan koden 000 angis under identifikasjonsnummeret <400>, dvs på linjen under det angitte SEQ ID NO, som erstatning for den manglende sekvensen.

I søknadens beskrivelse, krav og sammendrag henvises det til sekvenser som er angitt i sekvenslisten, ved bruk av sekvensidentifikasjonsnummeret, angitt ved "SEQ ID NO: x".

Nukleotid- og aminosyresekvenser skal bli anført på en av de tre følgende måter:

(i) en nukleotidsekvens

(ii) en aminosyresekvens

(iii) en nukleotidsekvens sammen med den korresponderende aminosyresekvensen. 

For de sekvensene som blir anført som nevnt under (iii), må aminosyresekvensen angis separat i sekvenslisten som en ren aminosyresekvens med et eget sekvensidentifikasjons-nummer.

8.1.4 Nukleotidsekvenser (eksempel gis i 8.1.10)

Nukleotidsekvenser skal angis som en enkelttråd i retningen 5' til 3' fra venstre mot høyre. Endemerkingen 3' og 5' skal ikke angis i sekvensen.

Basene i nukleotidsekvensen skal angis ved bruk av en-bokstavkoder, angitt som små bokstaver i samsvar med listen i tabell 1.

I selve sekvensen skal modifiserte baser angis som den tilsvarende umodifiserte basen eller som "n", forutsatt at den modifiserte basen er en av basene som er angitt i tabell 2.
Modifiseringen kan beskrives i sekvenslisten, under <220> "Sekvensens egenskaper", eller i beskrivelsen, men ikke i selve sekvensen, ved bruk av godkjente koder angitt i tabell 2. Symbolet "n" er ekvivalent med bare ETT ukjent eller ETT modifisert nukleotid.

En nukleotidsekvens skal angis med maksimum seksti (60) baser pr linje, med et mellomrom mellom hver gruppe på 10 baser.

Basene i en ikke-kodende nukleotidsekvens skal angis i grupper på 10 baser, mens kodende nukleotidsekvens skal angis som basetripletter (kodons).
Overskytende grupper på mindre enn ti (10) baser ved slutten av en ikke-kodende sekvens, skilles fra omkringliggende grupper med et mellomrom.

Nummereringen av nukleotidene skal starte ved den første basen i sekvensen med nummer 1. Nummerering av basene skal skje i retningen 5' til 3'.
I høyre marg angis nummeret på den siste basen på den aktuelle linjen.

For sirkulære nukleotidsekvenser kan startsted for nummereringen velges fritt av søker.

En nukleotidsekvens som består av en eller flere ikke-kontinuerlige segmenter av en større sekvens, eller av segmenter fra forskjellige sekvenser, skal nummereres som separate sekvenser med separate sekvensidentifikasjonsnummer. Tilsvarende gjelder for en sekvens med en eller flere gap, slik at antallet sekvenser er likt med antallet segmenter.

8.1.5 Aminosyresekvenser (eksempel gis i 8.1.10)

Aminosyrene i en protein- eller peptidsekvens skal angis i retningen amino til karboksy fra venstre mot høyre. Amino- og karboksygruppene skrives ikke i sekvensen.

Aminosyresekvenser skal angis ved bruk av trebokstavkoder, hvor den første bokstaven skal være en stor bokstav i samsvar med symbolene i tabell 3. En aminosyresekvens som inneholder en blank eller et internt termineringssymbol (for eksempel "Ter" eller "*" eller "."), skal presenteres som en separat aminosyresekvens og ikke angis i en enkel aminosyresekvens.

I selve sekvensen skal modifiserte eller uvanlige aminosyrer angis som den tilsvarende umodifiserte aminosyren eller som Xaa, forutsatt at den modifiserte aminosyren er en av dem som er angitt i tabell 4. Modifiseringen skal beskrives ytterligere i sekvenslisten under <220> "Egenskaper" eller i søknadens beskrivelse, men ikke i selve sekvensen, ved bruk av de angitte koder i tabell 4. Aminosyresekvenser som inneholder post-translasjonelt modifiserte aminosyrer, skal angis som den opprinnelige aminosyresekvensen ved bruk av symbolene i tabell 3.
Symbolet "Xaa" er ekvivalent til bare EN ukjent eller modifisert aminosyre.

En protein- og peptidsekvens skal angis med maksimum seksten (16) aminosyrer per linje og med et mellomrom mellom hver aminosyre.

Aminosyrer som tilsvarer kodonene i de kodende delene av nukleotidsekvensen, skrives rett under tilsvarende kodon. Hvis kodonet er delt ved et intron, skrives aminosyresymbolet under den del av kodonet som inneholder to nukleotider.

Nummereringen av aminosyresekvenser begynner ved den første aminosyren ved den N-terminale delen av det modne proteinet med nummer 1.
Pre-, pro-, pre-pro- og signalsekvenser kan ha negative tallverdier regnet fra første aminosyre av det modne proteinet, dersom det er ønskelig. Null (0) brukes ikke for å skille forannevnte sekvenser fra det modne proteinet. Nummereringen skal angis under hver femte (5.) aminosyre i sekvensen.

For sirkulære aminosyresekvenser kan startsted for nummereringen velges fritt av søker.

En aminosyresekvens som er bygget opp av en eller flere ikke-kontinuerlige segmenter fra en større sekvens, eller av segmenter fra forskjellige sekvenser, skal nummereres som separate sekvenser, med separate sekvensidentifikasjonsnummer. En sekvens med en eller flere gap, skal nummereres som separate sekvenser med egne sekvensidentifikasjonsnummer.

8.1.6 Annen tilgjengelig informasjon i sekvenslisten

Rekkefølgen av informasjon i sekvenslisten skal følge rekkefølgen i standardoppsettet (II, 8.1.9.1).

Bare identifikasjonsnummer for dataelementer som er definert i standardoppsettet, skal benyttes for presentasjon av informasjon i sekvenslisten. De korresponderende beskrivelsene av identifikasjonsnummerne skal ikke benyttes. Informasjonen skal følge umiddelbart etter identifikasjonsnummeret, og det er bare identifikasjonsnummer med relevant informasjon som bør angis i sekvenslisten. To unntak til dette er identifikasjonsnummerne <220> "Egenskaper" og <300> "Relevant publisert informasjon" , og som er tilknyttet informasjon i <221> til <223> og <301> til <313>. Disse identifikasjonsnummerne skal alltid inkluderes, men eventuelt være blanke.

Generelt skal det være en blank linje mellom ulike identifikasjonsnummer, hvis tallet i første eller andre posisjon er endret. Et unntak til dette er at det ikke skal være noen blank linje før identifikasjonsnummeret <310> "Patent- eller søknadsnummer". I tillegg skal det være en blank linje foran ethvert gjentatt identifikasjonsnummer.

8.1.6.1 Obligatoriske dataelementer

Sekvenslisten skal inneholde, i tillegg til og umiddelbart foran den aktuelle nukleotid- og/eller aminosyresekvensen, den følgende informasjonen:

Identifikasjonsnummer:
Beskrivelse av identifikasjonsnummer, angis ikke i sekvenslisten
<110> Søkerens navn
<120> Benevnelsen på oppfinnelsen
<160> Totalt antall SEQ ID NO
<210> SEQ ID NO: x
<211>  Sekvensens lengde
<212>  Sekvenstype
<213>  Opprinnelse
<400> SEQ ID NO: x og selve sekvensen
 

Hvis navnet til søkeren ikke er skrevet i henhold til det latinske alfabetet, skal navnet angis enten ved en ren omskriving ved bruk av bokstaver i det latinske alfabetet eller ved en oversettelse til engelsk.

Dataelementene, med unntak av de som er under identifikasjonsnumrene <110>, <120> og <160> skal gjentas for hver sekvens i sekvenslisten. Hvis ingen sekvens er tilgjengelig, er bare dataelementer under identifikasjonsnumrene <210> og <400> er obligatoriske.

Hvis sekvenslisten innleveres før søknaden har fått et søknadsnummer skal følgende dataelement medtas i sekvenslisten:

Identifikasjonsnummer

Beskrivelse av identifikasjonsnummeret, angis ikke i sekvenslisten
<130> Referanse

Når sekvenslisten inngis etter at søknaden som den er en del av, har fått et søknadsnummer, skal følgende dataelementer medtas i sekvenslisten:

Identifikasjonsnummer

Beskrivelse av identifikasjonsnummeret, angis ikke i sekvenslisten
<140> Søknadens nummer
<141> Søknadens inngivelsesdag

Når sekvenslisten tilhører en søknad som begjærer prioritet fra en tidligere søknad, skal følgende dataelementer medtas i sekvenslisten:

Identifikasjonsnummer
Beskrivelse av identifikasjonsnummeret, angis ikke i sekvenslisten
<150> Prioritetssøknadens nummer
<151> Prioritetssøknadens inngivelsesdag


Hvis "n" eller "Xaa" eller en modifisert base eller en modifisert eller uvanlig L-aminosyre er angitt i sekvensen, er de følgende dataelementene obligatoriske:

Identifikasjonsnummer Beskrivelse av identifikasjonsnummeret, angis ikke i sekvenslisten
<220>  Egenskaper
<221> Nøkkelord for beskrivelse av sekvensen iht. tabell 5 og 6
<222> Lokalisering
<223> Annen informasjon ("fri tekst")


Hvis opprinnelsen til sekvensen er "syntetisk sekvens" eller "ukjent", er de følgende dataelementene obligatoriske:

Identifikasjonsnummer
Beskrivelse av identifikasjonsnummeret, angis ikke i sekvenslisten
<220> Egenskaper
<223>  Annen informasjon ("fri tekst")
 


8.1.6.2 Valgfrie dataelementer

Alle dataelementer i standardoppsettet, som ikke er nevnt under 8.1.6.1 "Obligatoriske dataelementer", er valgfrie dataelementer.

8.1.6.3 Egenskaper

Ved angivelse av egenskapene til en sekvens under <220>, skal egenskapene beskrives ved hjelp av uttrykk angitt i tabell 5 og 6 (Disse tabellene inneholder utdrag fra DDBJ/EMBL/GenBank/SWISS PROT sine egenskapstabeller.).

8.1.6.4 Fritekst

Bruken av fritekst, under <223> "Annen informasjon angitt iht. tabell 1-6 eller ved bruk av fritekst" i sekvenslisten, skal begrenses til korte angivelser som er uunnværlige for å forstå sekvensen. Den skal ikke overskride 4 linjer med maksimum 65 tegn pr linje for hvert dataelement, når det skrives på engelsk. Ytterligere informasjon skal inkluderes i beskrivelsen på en av patentmyndigheten akseptert språk.

Fritekst skal fortrinnsvis være på engelsk.

Når sekvenslisten inneholder fritekst, skal denne friteksten gjentas i beskrivelsen på et av patentmyndigheten akseptert språk. Det anbefales at friteksten i beskrivelsen settes under overskriften "Sekvenslistefritekst".

8.1.7 Etterinnlevering av sekvenslister

Sekvenslister innlevert senere enn basisdokumentene eller endringer foretatt i tidligere angitte sekvenser, skal være ledsaget av en erklæring i henhold til Forskrift om nærmere bestemmelser til patentloven og patentforskriften:

§ 14-4. Ved inngivelsen av nye beskrivelseseksemplarer skal søkeren avgi en erklæring om hvilke deler av beskrivelsen som ikke stemmer med tidligere inngitt beskrivelse, samt på hvilken måte den endring som er foretatt, innebærer noe nytt med hensyn til realiteten. Med mindre særlige grunner tilsier noe annet, skal Patentstyret uten særskilt kontroll godta en slik erklæring.


8.1.8 Maskinlesbar form

En kopi av sekvenslisten skal inngis på maskinlesbar form hvis det er nødvendig av hensyn til nyhetsgranskningen av søknaden. Dette vil hovedsakelig gjelde søknader uten prioritet.

Enhver sekvensliste på maskinlesbar form, inngitt i tillegg til den skrevne/skriftlige sekvenslisten, skal være identisk med den skrevne listen og skal inneholde en erklæring om at informasjonen som finnes på maskinlesbar form er identisk med den skrevne sekvenslisten.

Hele sekvenslisten, skal finnes på EN elektronisk fil, fortrinnsvis på en diskett eller et annet elektronisk medium som aksepteres av eventuell internasjonal granskningsmyndighet (Patentstyret aksepterer maskinlesbare former som godkjennes av internasjonale granskningsmyndigheter). og skal kunne skrives ut. Filen som er lagret på diskett eller et annet elektronisk medium som aksepteres av eventuell internasjonal granskningsmyndighet, skal dekodes ved bruk av IBM (IBM-registrert varemerke) kodeangivelse side 437 (De spesifiserte kodeangivelsessider er de facto standarder for PC) , IBM kodeangivelse side 932 eller en kompatibel kodeangivelses side. En kompatibel kode side som vil være nødvendig for, for eksempel japansk, kinesisk, arabisk, gresk eller hebraiske bokstaver, er en som oversetter til romerske tall (med heksadesimal posisjon slik som i de ovennevnte spesifiserte kodeangivelsessidene) og alfabet.

Maskinlesbar form oppnås fortrinnsvis ved bruk av spesielt egnet software, slik som PatentIn (jf. punkt 8.1.1) eller andre dataprogrammer. Dette kan gjøres på hvilken som helst måte så lenge sekvenslisten på den inngitte diskett eller et annet elektronisk medium er lesbar på et operativsystem som aksepteres av eventuelle internasjonale granskningsmyndigheter. (Patentstyret aksepterer maskinlesbare former som godkjennes av internasjonale granskningsmyndigheter).

Fil-kompresjon er akseptert når man anvender diskett media, så lenge den komprimerte filen er på et selvutpakkende format som vil dekomprimere på et operativsystem system som aksepteres av eventuell internasjonal granskningsmyndighet.

Disketten eller et annet elektronisk medium som aksepteres av eventuell internasjonal granskningsmyndighet2, skal ha permanent merkelapp som inneholder søkers navn, oppfinnelsens tittel, et referansenr., datoen da dataene ble lagt inn, datamaskinens system og navnet på eventuell internasjonal granskningsmyndighet (Patentstyret aksepterer maskinlesbare former som godkjennes av internasjonale granskningsmyndigheter). 

Dersom disketten eller annet elektronisk medium som aksepteres av eventuell internasjonal granskningsmyndighet2 inngis etter søknadens inngivelsesdag, skal merkelappen også inneholde søknadsdag og -nummer.

Enhver korrigering av den skrevne sekvenslisten som skyldes åpenbare skrivefeil, skal følges av en sekvensliste på maskinlesbar form som inneholder denne rettelsen, korrigeringen eller endringen.

8.1.9 Standardoppsett og tabellsamling



8.1.9.1 Standardoppsett 

Identifikasjons-
nummer
Beskrivelse, angis ikke i sekvenslisten Obligatorisk (o) eller valgfritt (v)
<110> Søkerens navn O
<120> Oppfinnelsens benevnelse O
<130> Referanse O hvis sekvenslisten innleveres før søknaden har fått et søknadsnummer
<140> Søknadens nummer O hvis sekvenslisten inngis etter at søknaden har fått tildelt søknadsnummer
<141> Søknadens inngivelsesdag

O

<150> Prioritetssøknadens nummer O når sekvenslisten tilhører en søknad som begjærer prioritet fra en tidligere inngitt søknad
<151> Prioritetssøknadens inngivelsesdag O
<160> Totalt antall SEQ ID NO-er O Også sekvenser med kode 000 medregnes
<170> Software V
<210> SEQ ID NO sekvensidentifikasjonsnummeret skal være et helt tall som viser hvilken sekvens som angis O
<211> Sekvenslengde angitt ved antall basepar eller aminosyrer O
<212> Sekvenstype, dvs DNA, RNA, eller aminosyrer. Hvis sekvensen inneholder både DNA og RNA fragmenter, skal sekvensen betegnes DNA O men et kombinasjons DNA/RNA-molekyl beskrives nærmere under <220> til <223>
<213> Angivelse av opprinnelig kildeorganisme for sekvensen, "syntetisk sekvens" eller "ukjent" O
<220>  Egenskaper O Tas med, men uten tekst, hvis sekvensen inneholder modifiserte aminosyrer eller nukleotider, uvanlige aminosyrer, eller hvis sekvensen er syntetisk eller ukjent
<221> Nøkkelord for beskrivelse av sekvensen iht. tabell 5 eller 6 O
<222> Lokalisering O med angivelse av posisjon eller område for modifiserte nukleotider eller aminosyrer, eller uvanlige aminosyrer
<223> Annen informasjon angitt iht. tabell 1-6 eller ved bruk av fritekst (II, 8.1.6.4) V hvis sekvensen er syntetisk eller ukjent
<300> Relevant publisert informasjon V Tas med, men uten tekst. Repeteres for hver publikasjon
<301> Forfattere V
<302> Tittel på publikasjon V
<303> Navnet på tidsskrift hvor den relevante informasjonen er publisert V

<304>

Volum/bindnummer på tidsskriftet V
<305> Utgavenummer for tidsskriftet V
<306> Angivelse av sidenummer i tidsskriftet hvor dataene er publisert V
<307> Publiseringsdato for tidsskriftet V
<308> Tilgangsnummer tildelt av databasen, inkludert navn på database V
<309> Publiseringsdato i database
V
<310> Patent- eller søknadsnummer
V
<311> Inngivelsesdato for patent eller patentsøknad V
<312> Publiseringsdato for patent eller patentsøknad V
<313> Relevante residuer
<400> Sekvens Sekvensidentifikasjonsnummeret angis på linjen over selve sekvensen O
 

8.1.9.2 Tabellsamling 


Tabell 1: Symboler for baser

Symbol

Betydning

Symbolets opprinnelse

a a adenin
g g guanin
c c cytosin
t t thymin
u u uracil/uridin
r g eller a purin
y t/u eller c pyrimidin
m a eller c amino
k g eller t/u keto
s g eller c strong interactions
3-H-bindinger
w a eller t/u weak interactions
2-H-bindinger
b g eller c eller t/u not a
d a eller g eller t/u not c
h a eller c eller t/u not g
v a eller g eller c not t, not u
n a eller g eller c eller t/u, ukjent, eller andre any

   

Tabell 2: Symboler for modifiserte nukleotider
 

Symbol

Betydning

ac4c 4-acetylcytidin
chm5u 5-(karboksyhydroksymetyl)uridin
cm 2'-O-metylcytidin
cmnm5s2u 5-karboksymetylaminometyl-2-tiouridin
cmnm5u 5-karboksymetylaminometyluridin
d dihydrouridinfm
fm 2'-O-metylpseudouridin
gal q beta, D-galaktosylqueuosin
gm 2'-O-metylguanosin
i inosin
i6a N6-isopentenyladenosin
m1a 1-metyladenosin
m1f 1-metylpseudouridin
m1g 1-metylguanosin
m1i 1-metylinosin
m22g 2,2-dimetylguanosin
m2a 2-metyladenosin
m2g 2-metylguanosin
m3c 3-metylcytidin
m5c 5-metylcytidin
m6a N6-metyladenosin
m7g 7-metylguanosin
mam5u 5-metylaminometyluridin
mam5s2u 5-metoksyaminometyl-2-tiouridin
man q beta, D-mannosylqueuosin
mcm5s2u 5-metoksykarbonylmetyl-2-tiouridin
mcm5u 5-metoksykarbonylmetyluridin
mo5u 5-metoksyuridin
ms2i6a 2-metyltio-N6-isopentenyladenosin
ms2t6a N-((9-beta-D-ribofuranosyl-2-metyltiopurin-6-yl) karbamoyl)treonin
mt6a N-((9-beta-D-ribofuranosylpurin-6-yl) N-metylkarbamoyl)treonin
mv uridin-5-oksyeddiksyremetylester
o5u uridin-5-oksyeddiksyre (v)
osyw wybutoxosin
p pseudouridin
q queuosin
s2c 2-tiocytidin
s2t 5-metyl-2-tiouridin
s2u 2-tiouridin
s4u 4-tiouridin
t 5-metyluridin
t6a N-((9-beta-D-ribofuranosylpurin-6-yl)karbamoyl)treonin
tm 2'-O-metyl-5-metyluridin
um 2'-O-metyluridin
yw wybutosin
x 3-(3-amino-3-karboksypropyl)-uridin,(acp3)u
 

Tabell 3: Symboler for L-aminosyrer
 

Symbol

Betydning

Ala Alanin
Cys Cystein
Asp Asparginsyre
Glu Glutaminsyre
Phe Phenylalanin
Gly Glycin
His Histidin
Ile Isoleucin
Lys Lysin
Leu Leucin
Met Methionin
Asn Asparagin
Pro Prolin
Gln Glutamin
Arg Arginin
Ser Serin
Thr Threonin
Val Valin
Trp Tryptophan
Tyr Tyrosin
Asx Asp eller Asn
Glx Glu eller Gln
Xaa ukjent eller annen

Tabell 4: Symboler for modifiserte eller uvanlige aminosyrer
 

Symbol

Betydning

Aad 2-Aminoadipinsyre
bAad 3-Aminoadipinsyre
bA1a beta-Alanin,beta-Amino-propionsyre
Abu 2-Aminosmørsyre
4Abu 4-Aminosmørsyre, piperidinsyre
Acp 6-Aminokapronsyre
Ahe 2-Aminoheptansyre
Aib 2-Aminoisosmørsyre
bAib 3-Aminoisosmørsyre
Apm 2-Aminopimelinsyre
Dbu 2,4-Diaminosmørsyre
Des Desmosin
Dpm 2,2'-Diaminopimelinsyre
Dpr 2,3-Diaminopropionsyre
EtGly N-Etylglycin
EtAsn N-Etylasparagin
Hyl Hydroksylysin
aHyl allo-Hydroksylysin
3Hyp 3-Hydroksyprolin
4Hyp 4-Hydroksyprolin
Ide Isodesmosin
alle allo-Isoleucin
MeGly N-Metylglycin, sarcosin
Melle N-Metylisoleucin
MeLys 6-N-Metyllysin
MeVal N-Metylvalin
Nva Norvalin
Nle Norleucin
Orn  Ornitin

    

Tabell 5: Nøkkelord for beskrivelse av nukleotidsekvenser
 

Nøkkelord <221>

 Beskrivelse

allele stabile, alternative former av det samme genet og som er ulik den presenterte sekvensen i ett eller flere områder i et beslektet individ eller en stamme
attenuator (1) et område av DNA hvor terminering av transkripsjon reguleres og som kontrollerer ekspresjon av enkelte bakterie operoner
(2) sekvenssegment som er lokalisert mellom promoteren og det første strukturelle genet og som forårsaker delvis terminering av transkripsjon
C-region konstant region i lett og tung immunoglobulinkjede samt i T-celle reseptor alfa, beta og gamma kjeder; inneholder en eller flere exoner avhengig av den aktuelle kjeden
CAAT-signal del av en konservert sekvens som er lokalisert rundt 75 bp oppstrøms for startpunktet for eukaryote transkripsjonenheter og som kan være involvert i RNA polymerase binding; konsensus = GG(C eller T)CAATCT
CDS = kodende sekvens, en sekvens av nukleotider som korresponderer til en sekvens av aminosyrer i et protein (inkluderer stopp-kodoner); egenskapen inkluderer aminosyre "conseptual" translasjon
conflict uavhengige angivelser av "samme" sekvens som avviker på dette stedet eller i dette området
D-loop et område i mitokondrielt DNA hvori den ene DNA-tråden fortrenges av en kort RNA som baseparer med den gjenværende DNA-tråden. Betegnelsen brukes også for å beskrive erstatning av et område i duplex DNA med en annen enkelttråd i en reaksjon som katalyseres av RecA proteinet
D-segment = diversitetssegment, i tung immunoglobulin kjede og i T-celle reseptor beta kjede
enhancer cis-virkende sekvens som øker effektiviteten av (noen) eukaryote promotere, den fungerer i begge retninger og i hvilken som helst lokalisering (oppstrøms eller nedstrøms) i forhold til promoteren
exon et område av genomet som koder for hele eller deler av spleiset/modent mRNA; kan inneholde 5`UTR, alle CDS og 3`UTR
GC-signal et konservert GC-rikt område lokalisert oppstrøms for startpunktet for eukaryote transkripsjonsenheter og som kan foreligge i multiple kopier og/eller i begge retninger; konsensus = GGGCGG
gene et avgrenset område avDNA sekvensen som koder for et protein/polypeptid (som er identifisert som et gen og er tildelt et navn)
iDNA = interviening DNA, sekvens som elimineres gjennom en hvilken som helst form for rekombinasjon
intron et DNA-segment som transkriberes, men som fjernes fra transkriptet vha. spleising av sekvensene (eksonene) på hver side av den
J-segment Joining-segment, for lett og tung immunoglobulinkjede samt T-cellereseptor alfa, beta og gamma kjede
LTR Long terminal repeat, en sekvens som er direkte repetert på begge ender av en definert sekvens, og som er av den typen som typisk finnes i retrovirus
mat-peptid = mature peptide, modent peptid eller proteinkodende sekvens; kodende sekvens for det modne peptid- eller proteinproduktet som har gjennomgått post-translasjonell modifisering, lokaliseringen inkluderer ikke stopp-kodon (i motsetning til den korresponderende CDS)
misc-binding et sted i nukleinsyren som kovalent eller ikke-kovalent binder en annen del og som ikke kan beskrives ved nøkkelordene primer-bind eller protein-bind
misc-difference egenskap ved en sekvens som er forskjellig fra den som er presentert i innledningen og som ikke kan beskrives ved nøkkelordene conflict, unsure, old-sequence, mutation, variation, allele eller modified-base
misc-feature en egenskap ved en sekvens av biologisk interesse som ikke kan beskrives ved noe annet nøkkelord; en ny eller sjelden egenskap
misc-recomb sete for enhver generalisert, sete-spesifikk eller replikativ rekombinerings hendelse, hvor det er et brudd og en gjenforening av duplex DNA, og som ikke kan beskrives ved de andre rekombinerings-nøkkelordene iDNA og virion eller ved et betegnende kilde-nøkkelord /insertion-seq, /transposon, /proviral
misc-RNA ethvert transkript eller RNA produkt som ikke kan defineres ved de andre RNA-nøkkelordene prim-transcript, precursor-RNA, mRNA, 5`clip, 3`clip, 5`UTR, 3`UTR, exon, CDS, sig-peptide, transit-peptide, mat-peptide, intron, polyA-site, rRNA, tRNA, scRNA og snRNA
misc-signal ethvert område som inneholder et signal som kontrollerer eller endrer gen-funksjonen eller ekspresjonen og som ikke kan beskrives ved de andre signal-nøkkelord promoter, CAAT-signal, TATA-signal, -35-signal, -10-signal, GC-signal, RBS, polyA-signal, enhancer, attenuator, terminator og rep-origin
misc-structure enhver sekundær eller tertiær struktur eller konformasjon som ikke kan beskrives ved de andre struktur-nøkkelordene stem-loop og D-loop
modified-base det indikerte nukleotid er et modifisert nukleotid og skal substitueres av det indikerte molekyl (oppgitt i mod-base betegnende verdi)
mRNA inkluderer 5`UTR, CDS, exon og 3`UTR
mutation en DNA-sekvens som har en plutselig inntruffet arvelig endring i sekvensen
N-region ekstra nukleotider som er innskutt mellom rearrangerte immunoglobulin segmenter
old-sequence den viste sekvens korrigerer en tidligere utgave av sekvensen på dette stedet
polyA-signal gjennkjenningssted som er nødvendig for endonuklease spalting av et RNA transkript og som etterfølges av polyadenylering; konsensus = AATAAA
polyA-site et sted på RNA transkriptet hvor adenin residuer vil legges til ved post-transkripsjonell polyadenylering
precursor-RNA = forløper RNA, ethvert RNA som enda ikke er det modne RNA produktet; kan inneholde 5`clip, 5`UTR, CDS, exon, intron, 3`UTR og 3`clip
prim-transcript det første (uprosseserte) transkriptet; omfatter 5`clip, 5`UTR, CDS, exon, intron, 3`UTR og 3`clip
primer-bind ikke-kovalent bindingssete for start av replikasjon, transkripsjon eller revers transkripsjon; omfatter sete(r) for syntetiske, for eksempel PCR primer elementer
promoter område av DNA molekyl som er involvert i RNA polymerasebinding for å starte transkripsjon
protein-bind ikke-kovalent protein bindingssete på nukleinsyren
RBS = ribosom bindings sete
repeat-region et område av genomet som inneholder repeterte enheter
repeat-unit et enkelt repetert element
rep-origin replikasjonsorigo, startpunkt for replikasjon av nukleinsyren for å gi to identiske kopier
rRNA modent ribosomalt RNA; RNA bestanddelen av ribonukleoprotein partikkelen (ribosom) som setter sammen aminosyrer til proteiner
S-region switch område i tung immunoglobulin kjede; involvert i rearrangeringen av tung kjede DNA som fører til ekspresjon av en annen immunoglobulin-klasse fra samme B-celle
satellite mange tandem-repetisjoner (identiske eller beslektet) av en kort enkel repeterende enhet; mange har en basesammensetning eller andre egenskaper som er forskjellig fra gjennomsnittet i genomet og som tillater dem å bli separert fra mengden (hoved båndet) av genomisk DNA
scRNA = lite cytoplasmisk RNA, hvilket som helst av de ulike cytoplasmiske RNA molekylene som er tilstede i cytoplasma og (noen ganger) i kjernen i eukaryoter
sig-peptide kodende sekvens for et signalpeptid; kodende sekvens for et N-terminalt område av et sekretert protein; dette området er involvert i å forankre den voksende peptid-kjeden i membranen; leder sekvens
snRNA Lite kjerne RNA, hvilket som helst av de mange små RNA typene som finnes i kjernen; flere av snRNAene er involvert i spleising eller andre RNA prosseserende reaksjoner
source

(kilde)

 identifiserer den biologiske kilden til et spesifisert område av sekvensen; dette nøkkelordet er obligatorisk; enhver oppføring må som et minimum ha ett enkelt kilde-nøkkelord som dekker hele sekvensen; mer enn ett kilde-nøkkelord pr. sekvens er tillatt
stem-loop = hårnål; et dobbelt-heliks område som er dannet ved base-paring mellom nærliggende (inverterte) komplementære sekvenser i enkelt-trådet RNA eller DNA
STS = sekvens merket sete,kort enkelt-kopi av en DNA sekvens som karakteriserer et kartleggingsmerke i genomet og som kan detekteres vha. PCR; et område av genomet kan kartlegges ved å bestemme rekkefølgen på en serie STSer
TATA-signal (TATA boks, Goldberg
-Hogness boks)
en konservert AT-rik septamer som finnes omkring 25 bp før startpunktet for enhver eukaryot RNA polymerase II-transkripsjonsenhet og som kan være involvert i å posisjonere enzymet for riktig initiering; konsensus = TATA(A eller T)A(A eller T)
terminator
en DNA sekvens som er lokalisert enten ved enden av et transkript eller ved siden av promoterregionen og som sørger for at RNA polymerasen avslutter transkripsjonen; kan også være sete for binding av repressor protein
transit-peptide kodende sekvens for et transit-peptid; kodende sekvens for et N-terminalt område i et kjerne-kodet organelle protein; dette området er involvert i post-translasjonell import av proteinet inn i organellen
tRNA modent transfer RNA; et lite RNA molekyl (75-85 baser langt) som formidler translasjonen av en nukleinsyresekvens til en aminosyresekvens
unsure forfatteren er usikker på den eksakte sekvensen i dette området
V-region det variable området i tung og lett immunoglobulinkjede og T-celle- reseptor alfa, beta og gamma kjeder; koder for den variable aminoterminale delen; kan bestå av V-segmenter, D-segmenter, N-regioner samt J-segmenter
V-segment variabelt segment i immunoglobulinenes lette og tunge kjeder og T-celle- reseptor alfa, beta og gamma kjeder; koder for mesteparten av det variable området (V-region) og de siste aminosyrene av leder peptidet
variation en beslektet stamme som inneholder stabile mutasjoner i det samme genet (for eksempel RFLPer, polymorfismer etc) og som skiller seg fra den viste sekvensen på dette stedet (og mulige andre)
3`clip området nærmest 3`-enden i et forløpertranskript som kuttes bort under prosesseringen
3`UTR området i 3`enden i et modent transkript (som etterfølger stopp kodonet) som ikke translateres til protein
5`clip området nærmest 5`-enden i et forløper transkript som kuttes bort under prosesseringen
5`UTR området i 5`enden i et modent transkript (som ligger foran initierings kodonet) som ikke translateres til protein
-10-signal (Pribnow boks) et konservert område omkring 10 bp oppstrøms for start punktet for den bakterielle transkripsjonenheten og som kan være involvert i bindingen av RNA polymerase; konsensus = TAtAaT
-35-signal en konservert heksamer omkring 35 bp oppstrøms for start punktet for den bakterielle transkripsjonenheten, konsensus = TTGACa [ ] eller TGTTGACA[ ]
  

Tabell 6: Nøkkelord for beskrivelse av aminpsyresekvenser
  

Nøkkelord
<221>

Beskrivelse

Acetylation N-terminal eller annen
Act-site aminosyre(r) som er involvert i aktiviteten til et enzym
Amidation generelt ved C-terminalen i et modent, aktivt peptid
Binding bindingssete for hvilken som helst kjemisk gruppe (co-enzym, prostetisk gruppe etc); de kjemiske egenskapene til gruppen angis i beskrivelsesfeltet
Blocked ubestemt N- eller C-terminal blokkerende gruppe
Ca-bind omfang av et calsiumbindende område
Carbohyd glykosyleringssete, egenskapene til karbohydratet (dersom det er kjent) er angitt i beskrivelsen
Chain omfang av en polypeptidkjede i det modne proteinet
Conflict forskjellige publikasjoner oppgir ulike sekvenser
Disulfid FRA og "TIL" endepunktene representerer de to residuene som er bundet ved en intrakjede-disulfidbinding; dersom "FRA" og "TIL" endepunktene er identiske, er disulfidbindingen en interkjedebinding og beskrivelsen angir egenskapene til kryss-bindingen
DNA-bind omfang av et DNA-bindende område
Domain omfang av et område av interesse i en sekvens; egenskapene til området er angitt i beskrivelsesfeltet
Farnesyl farnesylgruppe som er bundet gjennom en tioeter binding til et cysteinresidue
Formylation av den N-terminale methionin
Gamma-
carboxyglutamic-
acid hydroxylation
av asparagin, asparaginsyre, prolin eller lysin
Geranyl-geranyl geranyl-geranylgruppe som er bundet gjennom en tioeterbinding til et cysteinresidu
GPI-anchor glycosyl-fosfatidylinositol (GPI) gruppe som er koblet til alfa-karboksylgruppen i det C-terminale residuet av den modne formen av et protein
Helix sekundærstruktur; helikser, for eksempel _-heliks, 3(10) heliks eller Pi-heliks
Init-Met det er kjent at sekvensen starter med methionin
Lipid kovalent binding av en lipiddel
Metal bindingssete for et metallion
Methylation generelt av lysin eller arginin
Mod. Res. post-translasjonell modifisering av et residu
Mutagen sete som er eksperimentelt endret
Myristate myristatgruppe som er bundet gjennom en amidbinding til det N-terminale glycinresiduet i den modne formen av et protein eller til et indre lysinresidu
N-acyl-diglyceride N-terminal cystein i den modne formen av et prokaryot lipoprotein med en amid-bundet fettsyre og en glycerylgruppe, til hvilke to fettsyrer er bundet ved esterbindinger
Non-cons = ikke påfølgende residuer, angir at to residuer i en sekvens ikke er sammenhengende og at det er et antall usekvenserte residuer mellom dem
Non-ter et ytter-residuet i sekvensen er ikke det terminale residuet; dersom det benyttes til posisjon 1, viser det at den første posisjonen ikke er N-terminalen i det ferdige molekylet; dersom det benyttes i den siste posisjonen, viser det at denne posisjonen ikke er C-terminalen i det ferdige molekylet; det finnes ikke beskrivelsesfelt for dette nøkkelordet
NP-bind omfang av et nukleotidfosfatbindende område; egenskapene til nukleotidfosfatet er angitt i beskrivelsesfeltet
Palmitate palmitatgruppe som er bundet gjennom en tioeter binding til et cysteinresidu eller gjennom en ester binding til en serin eller threonin residu
Peptide omfang av et frigitt, aktivt peptid
Phosphorylation av serin, threonin, tyrosin, asparaginsyre eller histidin
Propep omfang av et propeptid
Pyrrolidone carboxylic acid N-terminal glutamat som har dannet et indre syklisk lactam
Repeat omfang av en indre sekvens-repetisjon
Signal omfang av en signalsekvens (prepeptid)
Similar omfang av en likhet med en annen proteinsekvens; presis informasjon i forhold til sekvensen er angitt i beskrivelsesfeltet
Site ethvert annet interessant sete i sekvensen
Strand sekundærstruktur; for eksempel b-plate, hydrogen bundet beta-tråd eller residuer i en isolert beta-bro
Sulfatation generelt av tyrosin
Thiolest FRA og "TIL" endepunktene representerer de to residuene som er bundet ved tiolester bindingen
Thioleth FRA og "TIL" endepunktene representerer de to residuene som er koblet ved tioleter bindingen
Transit omfang av et transit peptid (mitokondrielt, kloroplastisk eller for en microbody)
Transmem omfang av et transmemrant område
Turn sekundærstruktur-dreining; for eksempel H-bundet dreining (3-, 4- eller 5-dreining)
Unsure = usikkerheter i sekvensen, benyttes til å beskrive område(r) av en sekvens der forfatteren er usikker på sekvens anvisningen
Variant forfatteren oppgir at varianter av sekvensen finnes
Varsplic beskrivelse av sekvensvarianter som er lagd ved alternativ spleising
Zn-finger omfang av et sinkfinger område
  


8.1.10 Eksempelsamling 

 

<110> Smith, John; Smithgene Inc.


<120> Example of a Sequence Listing


<130> 01-00001


<140> PCT/EP98/00001

<141> 1998-12-31


<150> US 08/999,999

<151> 1997-10-15


<160> 4


<170> PatentIn version 2.0


 <210> 1

<211> 389

<212> DNA

<213> Paramecium sp.


<220>

<221> CDS

<222> (279) (389)


<300>

<301> Doe, Richard

<302> Isolation and Characterization of a Gene Encoding a Protease from            Paramecium sp.

<303> Journal of Genes

<304> 1

<305> 4

<306> 1-7

<307> 1988-06-31

<308> 123456

<309> 1988-06-31


<400> 1

agctgtagtc attcctgtgt cctcttctct ctgggcttct caccctgcta atcagatctc 60
agggagagtg tcttgaccct cctctgcctt tgcagcttca caggcaggca ggcaggcagc 120
tgatgtggca attgctggca gtgccacagg cttttcagcc aggcttaggg tgggttccgc 180
cgcggcgcgg cqgcccctct cgcqctcctc tcgcgcctct ctctcgctct cctctcgctc  240
ggacctgatt aggtgagcag gaggaggggg cagttagc atg gtt tca atg ttc agc 296
 Met Val Ser Met Phe Ser 
     1 5 

ttg tct ttc aaa tgg cct gga ttt tgt ttg ttt gtt tgt ttg ttc caa 344
Leu Ser Phe Lys Trp Pro Gly Phe Cys Leu Val Cys Leu Phe Gln Cys 
                10                    15     20

 

tgt ccc aaa gtc ctc ccc tgt cac tca tca ctg cag ccg aat ctt 389
Pro Lys Val Leu Pro Cys His Ser Ser His Leu Gln Pro Asn Leu 
25 30 35

 

210> 2

211> 37

212> PRT

213> Paramecium sp.


400> 2

Met Val Ser Met Phe Ser Leu Ser Phe Lys Trp Pro Gly Phe Cys Leu 
 1     5             10 15

Val Cys Leu Phe Gln Cys Pro Lys Val Leu Pro Cys His Ser Ser His 
     20 25    30

 

Leu Gln Pro Asn Leu  
35 


210> 3

211> 11

212> PRT

213> Artificial Sequence


220>

223> Designed peptide based on size and polarity to act as a linker between the alpha and beta chains of Protein XYZ.


400> 3

Met Val Asn Leu Glu Pro Met His Thr Glu Ile
  1 5 10

 

210> 4


400> 4

000

Sist endret: 29.03.2004 O Også sekvenser med kode 000 medregnes


Utviklet i samarbeid med Gazette