På grunn av avgiftsfritak er biodrivstoff i stor grad billigere per liter biodrivstoff.  Biodiesel er fritatt for både drivstoff- og CO2-avgift uansett innblandingsandel. Bioetanol er fritatt for CO2-avgift, men slipper bare drivstoffavgift dersom andelen bioetanol utgjør minst 50 prosent av det ferdige produktet. Biodrivstoff har imidlertid mindre energiinnhold enn bensin og diesel, så den totale besparelsen ved overgang til biodrivstoff er avhengig av blant annet innblanding og type biodrivstoff.