Dersom biodrivstoff blir produsert av matvekster som for eksempel mais vil dette kunne føre til økte priser matvarepriser. Økt konkurranse om dyrkbar jord kan også presse opp matvareprisene. Det er knyttet usikkerhet til hvor stor sammenhengen er mellom biodrivstoffproduksjon og økte matvarepriser. Både Verdensbanken og Det internasjonale pengefondet (IMF) hevder at biodrivstoffproduksjon har innvirkning på matpriser, men bare som en av mange faktorer. Høy økonomisk vekst og befolkningsvekst i store land i verden vil gi økt etterspørsel. Andre forhold som påvirker matvareprisene er høyere priser på innsatsfaktorer (energi, kunstgjødsel), subsidiering av matproduksjon i vestlige land og dårlige avlinger for jordbruksprodukter.

Biodrivstoffets påvirkning på matvaresikkerhet vil variere ut fra flere regionale forhold knyttet til den enkelte biodrivstoffproduksjon. For eksempel vil biodrivstoff produsert av matvekster ha større negativ påvirkning på matvaresikkerhet enn produksjon av andregenerasjons biodrivstoff basert på for eksempel trevirke eller avfallsprodukter, hvor konkurransen mellom råstoff til produksjon mat og drivstoff ikke er like sterk.

Økte matvarepriser er heller ikke utelukkende negativt for utviklingsland. Land med nettoeksport vil totalt sett tjene på høyere priser på matvareprodukter. Hvordan denne fortjenesten vil få konsekvenser for landets befolkning avhenger av nasjonale fordelingsmekanismer og eierforhold. Bønder som er nettoprodusenter av mat vil ved økte matvarepriser få bedre betalt for avlingene sine.