Polarjoen hekker i arktiske områder i Nord-Amerika og gjennom hele den nordlige delen av Sibir. Fugler fra de russiske hekkeområdene passerer gjennom Barentshavet og langs norskekysten i forbindelse med trekket vår og høst på vei til og fra overvintringsområdene utenfor Vest-Afrika. Polarjoen hekker ikke på Svalbard, men den observeres regelmessig langs kysten og i de omkringliggende havområdene, særlig i sørøst.

Polarjoen opptrer vanligvis i flokk under trekket, mens tyvjoen vanligvis observeres som enkeltfugler eller i små grupper på to til fire fugler. Polarjoen følger ofte båter eller flokker av andre sjøfugler, som krykkje. Den livnærer seg på egg og unger fra andre fugler, smågnagere der disse finnes og som kleptoparasitt (stjeler mat fra andre fugler).