Forurensningen stammer hovedsakelig fra utslipp fra magnesiumfabrikken på Herøya.

Det langsiktige forvaltningsmålet for fjordene i Grenland er at forurensende sedimenter ikke skal hindre allmennhetens bruk (rekreasjon og friluftsliv) og næringsutnyttelse av fjordområdene. Dette innebærer en ambisiøs målsetning om å få opphevet kostholdsrådene og omsetningsforbudet i Grenlandsområdet innen 2015 (Frierfjorden og utenfor Langesund) og 2027 (mellom Brevik og Mølen-Langesund). 

Undersøkelser skal nå igangsettes for å avklare i hvilken grad andre kilder som avrenning fra byområder, industri og Skiensvassdraget bidrar til forurensning av fjorden.

Tynntildekking av forurenset sjøbunn utredes for tiden for å avklare om metoden kan benyttes til miljøforbedring av sjøbunnen i deler av fjorden. Grenland Havn utreder for tiden om deres aktivitet medfører spredning av forurensning til sjø og om det er nødvendig å gjennomføre tiltak for å hindre dette. De største industrihavnene i området skal i løpet av 2009 gjennomføre tilsvarende utredninger og avklaringer.

På Klosterøya ved Skien, har Norske Skog Union undersøkt miljøtilstanden på land og i vann. Tiltak for å hindre spredning av forurensning fra land til vann skal gjennomføres samtidig som eventuell spredning skal overvåkes noen år fremover. Tiltakene i vann skal sees i sammenheng med andre utredninger i Skienselva som skal gjennomføres de neste årene.

Grenlandsfjordene. Kart: SFT. (Klikk på bildet for stor versjon.)