I løpet av de siste 5 årene er det gjennomført flere tiltak under paraplyen pilotprosjekt Kristiansandsfjorden for å forbedre miljøtilstanden i sjø og sjøbunn.

I Hannevika, i sjøen utenfor Xstrata Nikkel AS, er det gjennomført tildekking av forurenset sjøbunn.

Forurenset sjøbunn er mudret i småbåthavnene, Auglandsbukta, Christiansholm og Justvik. Massene er deponert i et strandkantdeponi som er etablert både for å samle opp avrenning fra en gammel avfallsfylling og å fungere som et lokalt mottak for mudrede forurenset masse.

For å hindre oppvirvling av forurenset sjøbunn rundt fergeterminalen har Kristiansand havn KF sørget for tiltak (tildekking med betongmadrasser) for å hindre oppvirvling av forurenset sjøbunn.

Høsten 2008 startet Forsvaret opprydding av PCB-forurenset sjøbunn i Marvika og Torsvika. Arbeidet forventes ferdig medio 2009.

Ved Bredalsholmen veteranskipsverft er gamle deponier enten fjernet eller kapslet inn. Noe arbeid gjenstår.

Ved Elkem Fiskå er tiltak for å rydde opp i forurenset grunn og utslipp av PAH til sjø via prosessvann redusert betydelig. 

I løpet av 2009 skal nytt overvåkingsprogram for det indre fjordområdet etableres. Arbeidet koordineres av Fylkesmannen. Det pågår utredninger og planlegges ytterligere tiltak i Kristiansandsfjorden i årene fremover for å oppnå miljømålsetningen for fjorden.

Kristiansandsfjorden. Kart: SFT. (Klikk på bildet for stor versjon.)